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Original title:
Selected Communications Theoretic Aspects in Genetics 
Translated title:
Ausgewählte Anwendungen der Kommunikations- und Informationstheorie in der Genetik 
Year:
2010 
Document type:
Dissertation 
Institution:
Fakultät für Elektrotechnik und Informationstechnik 
Advisor:
Hagenauer, Joachim (Prof. Dr. Dr. E.h.) 
Referee:
Bossert, Martin (Prof. Dr.) 
Language:
en 
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik; ELT Elektrotechnik 
Keywords:
communication engineering, information theory, genetics, molecular biology, sequence alignment, compression, synchronization, marker, binding site analysis 
Translated keywords:
Nachrichtentechnik, Kommunikationstheorie, Informationstheorie, Genetik, Molekulare Biologie, Sequenzalignment, Kompression, Synchronisation, Marker, Bindungsstellen 
Abstract:
This thesis covers novel applications of concepts from communications engineering to problems in molecular biology. In the first part the focus is placed on applying source coding techniques to reduce the storage requirement of multiple genome alignment datasets used in comparative genomics. A highly efficient lossless compression algorithm using well established models of genome evolution and binary image compression techniques is introduced. The second part studies parallels between sequence s...    »
 
Translated abstract:
Es werden neue Anwendungen der Kommunikations- und Informationstheorie auf Probleme in der molekularen Biologie behandelt. Im ersten Teil wird Quellencodierung genutzt um die Speicheranforderungen von genomweiten Sequenzalignment Datensätzen zu verringern. Ein hocheffizienter Kompressionsalgorithmus basierend auf statistischen Modellen der Evolution und Techniken aus der binären Bildcodierung wird vorgeschlagen. Im zweiten Teil werden die Parallelen zwischen der Marker Synchronisation über verra...    »
 
Oral examination:
06.08.2010 
Pages:
174 
Last change:
27.09.2010