Ammoniak oxidierend Bakterien (AOB) spielen im globalen Stickstoffkreislauf, in der Landwirtschaft, sowie bei der Abwasserreinigung eine essentielle Rolle. Da AOB nur sehr schwer und unter großem Zeitaufwand kultivierbar sind, erfolgt ihr Nachweis und ihre Identifizierung heute überwiegend molekular, mit Hilfe der vergleichenden Sequenzanalyse ihrer 16S rRNS- sowie amoA-Gene. Im Zuge dieser Arbeit wurden 16S rRNS- und amoA-Datenbanken erstellt, die alle veröffentlichten Sequenzen von AOB beinhalten. Zudem wurden die beiden Markermolekülsequenzen für weitere 44 AOB-Isolate ermittelt. Auf Basis der aktualisierten und erweiterten Datensätze wurden umfassende phylogenetische Analysen durchgeführt und ein "Genospezies-Konzept" für den Nachweis bisher unbekannter AOB-Arten in Umweltproben entworfen. Darüber hinaus wurde die Spezifität aller veröffentlichten Sonden und Primer für den Nachweis von AOB überprüft sowie Verbreitungsmuster der einzelnen AOB-Gruppen in der Umwelt aufgedeckt.     «

Ammoniak oxidierend Bakterien (AOB) spielen im globalen Stickstoffkreislauf, in der Landwirtschaft, sowie bei der Abwasserreinigung eine essentielle Rolle. Da AOB nur sehr schwer und unter großem Zeitaufwand kultivierbar sind, erfolgt ihr Nachweis und ihre Identifizierung heute überwiegend molekular, mit Hilfe der vergleichenden Sequenzanalyse ihrer 16S rRNS- sowie amoA-Gene. Im Zuge dieser Arbeit wurden 16S rRNS- und amoA-Datenbanken erstellt, die alle veröffentlichten Sequenzen von AOB beinhal...     »

Ammonia oxidizing bacteria (AOB) play an important role in the global nitrogen cycle, in agriculture, and in wastewater treatment. Cultivation of AOB is difficult and very time consuming. Therefore, today these bacteria are often detected and identified using molecular methods, especially comparative sequence analysis of their 16S rRNA- and amoA- genes. In this thesis 16S rRNA and amoA databases containing all published AOB sequences have been established. Moreover, the sequences of both marker molecules of 44 additional AOB isolates have been determined. Based on the updated and extended databases thorough phylogenetic analyses have been performed and a "genospecies-concept" for the detection of to-date unknown AOB species has been proposed. In addition, the specificity of all published primers and probes for the detection of AOB has been revaluated and natural distribution patterns of distinct AOB-groups have been revealed.     «

Ammonia oxidizing bacteria (AOB) play an important role in the global nitrogen cycle, in agriculture, and in wastewater treatment. Cultivation of AOB is difficult and very time consuming. Therefore, today these bacteria are often detected and identified using molecular methods, especially comparative sequence analysis of their 16S rRNA- and amoA- genes. In this thesis 16S rRNA and amoA databases containing all published AOB sequences have been established. Moreover, the sequences of both marker...     »