From low-throughput SSR genotyping to high-throughput SNP analyses of natural populations: validation of their application focused on non-invasive samples

Bayerl, Helmut

Helmut Bayerl

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Original title:: From low-throughput SSR genotyping to high-throughput SNP analyses of natural populations: validation of their application focused on non-invasive samples
Translated title:: Von der Niedrigdurchsatz-Genotypisierung von Mikrosatelliten hin zu Hochdurchsatz-SNP-Analysen natürlicher Populationen: Validierung ihrer Anwendung fokussiert auf non-invasives Probenmaterial
Author:: Bayerl, Helmut
Year:: 2019
Document type:: Dissertation
Faculty/School:: Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:: Kühn, Ralph (Prof. Dr.)
Referee:: Kühn, Ralph (Prof. Dr.); Geist, Jürgen (Prof. Dr.); Gula, Roman (Prof. Dr.)
Language:: en
Subject group:: BIO Biowissenschaften
Keywords:: microsatellite, SSR, single nucleotide polymorphism, SNP, conservation genetics, non-invasive genetic sampling, Eurasian otter, Lutra lutra, RAMseq
Translated keywords:: Mikrosatellit, SSR, Punktmutation, SNP, Naturschutzgenetik, non-invasive genetische Probenahme, Eurasischer Fischotter, Lutra lutra, RAMseq
TUM classification:: BIO 700d
Abstract:: Efficient genetics tools are needed to provide information on the genetic constitution of endangered species. DNA quantification as a means of quality assessment of non-invasive genetic samples and a novel approach of SNP detection in non-model species called Random Amplicon Sequencing (RAMseq) were developed. These were validated during a non-invasive genetic census of the Eurasian otter (Lutra lutra) and performance of developed SNP markers in population genetic analyses was compared to that of established microsatellites. «
Efficient genetics tools are needed to provide information on the genetic constitution of endangered species. DNA quantification as a means of quality assessment of non-invasive genetic samples and a novel approach of SNP detection in non-model species called Random Amplicon Sequencing (RAMseq) were developed. These were validated during a non-invasive genetic census of the Eurasian otter (Lutra lutra) and performance of developed SNP markers in population genetic analyses was compared to that o... »
Translated abstract:: Effektive genetische Methoden werden benötigt, um Informationen über die genetische Konstitution bedrohter Arten zu erhalten. Die DNA-Quantifizierung zur Qualitätsbestimmung non-invasiver Proben und eine neue Methode zur Detektion von SNP Markern in nicht-Modelltierarten, Random Amplicon Sequencing (RAMseq), wurden entwickelt. Diese wurden während eines non-invasiven genetischen Zensus des Eurasischen Fischotters (Lutra lutra) validiert und die Effizienz der entwickelten SNP Marker mit der von etablierten Mikrosatelliten verglichen. «
Effektive genetische Methoden werden benötigt, um Informationen über die genetische Konstitution bedrohter Arten zu erhalten. Die DNA-Quantifizierung zur Qualitätsbestimmung non-invasiver Proben und eine neue Methode zur Detektion von SNP Markern in nicht-Modelltierarten, Random Amplicon Sequencing (RAMseq), wurden entwickelt. Diese wurden während eines non-invasiven genetischen Zensus des Eurasischen Fischotters (Lutra lutra) validiert und die Effizienz der entwickelten SNP Marker mit der von e... »
WWW:: https://mediatum.ub.tum.de/?id=1497679
Date of submission:: 27.06.2019
Oral examination:: 26.09.2019
File size:: 8953739 bytes
Pages:: 199
Urn (citeable URL):: https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20190926-1497679-1-7
Last change:: 05.12.2019
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