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Original title:
Next Generation Machine Learning Prediction of Protein Cellular Sorting
Translated title:
Neue Ansätze zur Vorhersage von zellulärer Proteinsortierung mittels Machine Learning
Author:
Goldberg, Tatyana
Year:
2016
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Informatik
Advisor:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.)
Referee:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.); Bromberg, Yana (Prof. Dr.); Antes, Iris (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 110d
Abstract:
Determining the localization of a protein within a biological cell is important for understanding protein’s function, as certain functions can only be performed in certain cellular environments. Despite advances in high-throughput experiments, many proteins are still lacking any functional annotation. My work presents a series of novel machine learning-based approaches that predict localization from protein amino acid sequence and thus complement experimental annotations considerably.
Translated abstract:
Viele Proteinfunktionen können nur in bestimmten zellulären Kompartimenten ausgeübt werden. Deshalb ist die subzelluläre Lokalisierung wichtig, um die Funktion einzelner Proteine zu verstehen. Jedoch gestaltet sich die experimentelle Bestimmung der Proteinlokalisierung problematisch. Meine Arbeit beschreibt eine Reihe von neuen Machine Learning basierten Methoden, welche die zelluläre Lokalisierung der Proteine anhand ihrer Aminosäuresequenz vorhersagen und somit Annotationenen der Proteinfunkti...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1304188
Date of submission:
15.12.2016
Oral examination:
27.04.2016
File size:
20567626 bytes
Pages:
175
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20160427-1304188-1-3
Last change:
01.09.2016
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