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Originaltitel:
Discovering candidate regulatory networks in epigenomics and transcriptomics
Übersetzter Titel:
Entdeckung von regulatorischen Netzwerken in der Epigenomik und Transkriptomik
Autor:
Hoffmann, Markus Daniel
Jahr:
2023
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Life Sciences
Institution:
Lehrstuhl für Experimentelle Bioinformatik (Prof. Küster komm.)
Betreuer:
Hennighausen, Lothar (Ph.D.)
Gutachter:
Hennighausen, Lothar (Ph.D.); Baumbach, Jan (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
Stichworte:
gene regulatory networks, epigenomics, transcriptomics, computation
Übersetzte Stichworte:
Genregulatorische Netze, Epigenomik, Transkriptomik, Computation
TU-Systematik:
BIO 110
Kurzfassung:
The thesis introduces the pipelines TF-Prioritizer and circRNA-sponging for epigenomic and transcriptomic analysis. TF-Prioritizer streamlines the examination of transcription factors, cutting down on laborious ChIP-seq experiments, and has been validated in mammary gland research. circRNA-sponging automates the study of circular RNAs and their interactions with miRNAs, revealing differentially expressed circRNAs in mouse brain. These tools simplify regulatory studies, making gene regulation res...     »
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Arbeit werden die Pipelines TF-Prioritizer und circRNA-sponging für epigenomische und transkriptomische Analysen vorgestellt. TF-Prioritizer rationalisiert die Untersuchung von Transkriptionsfaktoren und reduziert die aufwändigen ChIP-seq-Experimente. circRNA-sponging automatisiert die Untersuchung von zirkulären RNAs und deren Interaktionen mit miRNAs und deckt unterschiedlich exprimierte circRNAs im Gehirn von Mäusen auf. Diese Werkzeuge vereinfachen regulatorische Studien und machen...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1720381
Eingereicht am:
18.09.2023
Mündliche Prüfung:
27.11.2023
Dateigröße:
13697114 bytes
Seiten:
122
Urn (Zitierfähige URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20231127-1720381-1-8
Letzte Änderung:
23.01.2024
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