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Originaltitel:
A Crystallographic and Molecular Dynamics Simulation Study of Protein Crystallization
Übersetzter Titel:
Kristallographische und Molekular Dynamische Simulationsstudien zur Proteinkristallisation
Autor:
Hermann, Johannes
Jahr:
2021
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Engineering and Design
Betreuer:
Weuster-Botz, Dirk (Prof. Dr.)
Gutachter:
Weuster-Botz, Dirk (Prof. Dr.); Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
CIT Chemie-Ingenieurwesen, Technische Chemie, Biotechnologie; PHY Physik
Stichworte:
Protein crystallization, Protein design, Protein engineering, Molecular dynamics simulation, Crystallography
Übersetzte Stichworte:
Proteinkristallisation, Protein Gestaltung, Protein Engineering, Molkulardynamik Simulation, Kristallographie
TU-Systematik:
CIT 900
Kurzfassung:
Crystallization of alcohol dehydrogenase from Lactobacillus brevis and mutants was modeled in silico. Neutron and X-ray crystallography allowed the generation of valid crystal structure models as input for subsequent molecular dynamics free energy simulations. Protein nucleation and crystal growth is guided by thermodynamically stabilizing interactions at crystal contacts. Free energy guided design of protein variants was found to be a powerful new tool to control protein crystallization.
Übersetzte Kurzfassung:
Die Kristallisation der Alkoholdehydrogenase aus Lactobacillus brevis und Mutanten wurde in silico modelliert. Mit Neutronen- und Röntgenkristallographie wurden Strukturmodelle für Molekulardynamik Simulationen erzeugt. Nukleation und Wachstum von Proteinkristallen wird thermodynamisch durch stabilisierende Interaktionen an Kristallkontakten bestimmt. Die Gestaltung von Proteinvarianten über freie Energie Berechnungen stellt somit ein neues Werkzeug zur Kontrolle der Proteinkristallisation dar.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1579462
Eingereicht am:
11.12.2020
Mündliche Prüfung:
27.05.2021
Dateigröße:
41572430 bytes
Seiten:
168
Urn (Zitierfähige URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20210527-1579462-1-4
Letzte Änderung:
12.01.2022
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