Exopolysaccharide, automated, modular, screening, platform, high-throughput, different genera, carbohydrate fingerprint
Translated keywords:
Exopolysaccharide, automatisiert, modular, Screening, Plattform, Hochdurchsatz, verschiedene Gattungen, Kohlenhydrat-Fingerabdruck
TUM classification:
CIT 680d
Abstract:
The goal of this work was to establish a method to tap the full potential of the unexplored diversity of microbial exopolysaccharide. To achieve this, an automated modular high throughput screening platform was developed. A newly established high-throughput-1-phenyl-3-methyl-5-pyrazolone (HT-PMP) method for the determination of sugars and sugar derivatives represents the backbone of the approach as it allows a fast carbohydrate fingerprint analysis. The combination of different detection systems in the automated fast screening enables a pre-selection of EPS producers. Based on this, the carbohydrate fingerprint can be specifically applied for positively evaluated hits. In sum, over 120 novel EPS producing strains from diverse genera were successfully identified with this approach in a short time.
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The goal of this work was to establish a method to tap the full potential of the unexplored diversity of microbial exopolysaccharide. To achieve this, an automated modular high throughput screening platform was developed. A newly established high-throughput-1-phenyl-3-methyl-5-pyrazolone (HT-PMP) method for the determination of sugars and sugar derivatives represents the backbone of the approach as it allows a fast carbohydrate fingerprint analysis. The combination of different detection systems...
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Translated abstract:
In der großen Vielfalt bisher unerforschter mikrobieller Exopolysaccharide liegt ein großes Potential für technische Anwendungen. Ziel dieser Arbeit war es, eine Methode zu entwickeln, um dieses Potential auszuschöpfen. Dafür wurde eine automatisierte, modulare Hochdurchsatz-Screening-Plattform etabliert. Im Zentrum dieser Methode steht die Analyse des Kohlenhydrat-Fingerabdrucks und hier insbesondere eine neu entwickelte Hochdurchsatz-1-Phenyl-3-Methyl-5-Pyrazolon (HT-PMP) Methode. Die Kombination verschiedener Bestimmungsmethoden im automatisierten Screening ermöglicht eine Vorauswahl von EPS Produzenten. Darauf basierend kann der Kohlenhydrat-Fingerabdruck ausschließlich für positiv bewertete Treffer durchgeführt werden. Zusammengefasst wurden mit dieser Methode bereits mehr als 120 neue EPS produzierende Stämme unterschiedlicher Gattungen erfolgreich identifiziert.
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In der großen Vielfalt bisher unerforschter mikrobieller Exopolysaccharide liegt ein großes Potential für technische Anwendungen. Ziel dieser Arbeit war es, eine Methode zu entwickeln, um dieses Potential auszuschöpfen. Dafür wurde eine automatisierte, modulare Hochdurchsatz-Screening-Plattform etabliert. Im Zentrum dieser Methode steht die Analyse des Kohlenhydrat-Fingerabdrucks und hier insbesondere eine neu entwickelte Hochdurchsatz-1-Phenyl-3-Methyl-5-Pyrazolon (HT-PMP) Methode. Die Kombinat...
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