Cellular proteins exist in a dynamic state in which they are continuously synthesized and degraded. Bottom-up proteomics technologies allow for the parallel assessment of turnover for thousands of proteins. Here, a new workflow for robust, time- and cost-efficient measurements of peptide turnover was established enabling the global study of hitherto widely neglected isoform- and modification-specific protein turnover. Further, the enormous potential of such measurements for prioritization of functional relevant modification sites is illustrated.
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Cellular proteins exist in a dynamic state in which they are continuously synthesized and degraded. Bottom-up proteomics technologies allow for the parallel assessment of turnover for thousands of proteins. Here, a new workflow for robust, time- and cost-efficient measurements of peptide turnover was established enabling the global study of hitherto widely neglected isoform- and modification-specific protein turnover. Further, the enormous potential of such measurements for prioritization of fun...
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Translated abstract:
Zelluläre Proteine existieren in einem dynamischen Zustand, in dem sie kontinuierlich synthetisiert und abgebaut werden. Bottom-Up-Proteomik ermöglicht die Bewertung des Umsatzes für Tausende von Proteinen gleichzeitig. Hier wurde ein neuer Workflow für robuste Messungen des Peptidumsatzes etabliert, der die globale Untersuchung des bisher weitgehend vernachlässigten Isoform- und modifikationsspezifischen Proteinumsatzes ermöglicht. Darüber hinaus wird das enorme Potenzial solcher Messungen zur Priorisierung funktional relevanter Modifikationen veranschaulicht.
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Zelluläre Proteine existieren in einem dynamischen Zustand, in dem sie kontinuierlich synthetisiert und abgebaut werden. Bottom-Up-Proteomik ermöglicht die Bewertung des Umsatzes für Tausende von Proteinen gleichzeitig. Hier wurde ein neuer Workflow für robuste Messungen des Peptidumsatzes etabliert, der die globale Untersuchung des bisher weitgehend vernachlässigten Isoform- und modifikationsspezifischen Proteinumsatzes ermöglicht. Darüber hinaus wird das enorme Potenzial solcher Messungen zur...
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