Mayer, Klaus F. X. (Prof. Dr.); Torres Ruiz, Ramón A. (Prof. Dr.); Schwab, Wilfried (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
Keywords:
pseudogenes, plants
Translated keywords:
Pseudogene, Pflanzen
Abstract:
Pseudogenes - often regarded as "evolutionary relics" or "junk DNA" - were annotated for 18 plants with varying genome sizes and economical importance. The Pseudogene Locus Identification Pipeline (PLIPipeline) was developed to identify pseudogenes via homology to functional genes. Numerous TE genes, pseudogenes and gene fragments were found. Their origin, structure, distribution and functional potential was estimated. This work suggests an enormous functional potential of these so far under-researched genetic elements.
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Pseudogenes - often regarded as "evolutionary relics" or "junk DNA" - were annotated for 18 plants with varying genome sizes and economical importance. The Pseudogene Locus Identification Pipeline (PLIPipeline) was developed to identify pseudogenes via homology to functional genes. Numerous TE genes, pseudogenes and gene fragments were found. Their origin, structure, distribution and functional potential was estimated. This work suggests an enormous functional potential of these so far under-re...
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Translated abstract:
Pseudogene, oft als "Relikte der Evolution" oder als "Junk DNA" abgetan, wurden für 18 Pflanzen von unterschiedlicher wirtschaftlicher Bedeutung annotiert. Die "Pseudogene Locus Identification Pipeline" (PLIPipeline) wurde entwickelt, um Pseudogene via Homologie zu funktionellen Genen zu identifizieren. Zahlreiche TE-Gene, Pseudogene und Genfragmente wurden gefunden. Ursprung, Struktur, Verteilung und funktionelles Potential wurden ermittelt. Die Ergebnisse dieser Arbeit deuten auf ein enormes funktionelles Potential dieser bislang wenig untersuchten genetischen Elemente hin.
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Pseudogene, oft als "Relikte der Evolution" oder als "Junk DNA" abgetan, wurden für 18 Pflanzen von unterschiedlicher wirtschaftlicher Bedeutung annotiert. Die "Pseudogene Locus Identification Pipeline" (PLIPipeline) wurde entwickelt, um Pseudogene via Homologie zu funktionellen Genen zu identifizieren. Zahlreiche TE-Gene, Pseudogene und Genfragmente wurden gefunden. Ursprung, Struktur, Verteilung und funktionelles Potential wurden ermittelt. Die Ergebnisse dieser Arbeit deuten auf ein enormes f...
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