Bacteria-phage interactions: Insights into quorum sensing-induced anti-phage defense, phage therapy and the pulmonary human virome composition
Translated title:
Bakterien-Viren Interaktionen: Einblicke in die Quorum Sensing induzierte Phagenabwehr, Phagentherapie und die Zusammensetzung des humanen Lungenviroms
Author:
Feichtmayer, Judith
Year:
2019
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Griebler, Christian (Priv.-Doz. Dr.)
Referee:
Griebler, Christian (Priv.-Doz. Dr.); Liebl, Wolfgang (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 250d
Abstract:
In this thesis the ecology of bacteria and phage interactions is elucidated. Lytic phages, active against Pseudomonas aeruginosa, were isolated and characterised for their potential use as therapeutic agents. The contribution of bacterial quorum sensing for a rapid development of anti-phage resistance was tested experimentally and with mathematical modeling. In addition to the evaluation of the effect of single phages, the influence of a variety of resident viruses on an ecosystem was investigated. Therefore, the contribution of the virome to an existing or developing dysbiosis was examined in human lung samples of patients suffering from chronic obstructive pulmonary disease and healthy individuals.
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In this thesis the ecology of bacteria and phage interactions is elucidated. Lytic phages, active against Pseudomonas aeruginosa, were isolated and characterised for their potential use as therapeutic agents. The contribution of bacterial quorum sensing for a rapid development of anti-phage resistance was tested experimentally and with mathematical modeling. In addition to the evaluation of the effect of single phages, the influence of a variety of resident viruses on an ecosystem was investiga...
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Translated abstract:
Zentrales Thema dieser Arbeit ist die Interaktion von Bakterien mit ihren Viren. Phagen mit einer lytischen Aktivität gegenüber Pseudomonas aeruginosa wurden isoliert und auf ihre Eignung als Therapeutika getestet. Die Beteiligung des bakteriellen Kommunikationsapparates Quorum Sensing an der Entstehung der antiviralen Resistenz wurde durch Experimente und Modellierungen überprüft. Zusätzlich zu dem Einfluss einzelner Viren wurde die Wirkung einer viralen Gemeinschaft auf ein Ökosystem analysiert. Die Mitwirkung des Viroms an einer bestehenden oder sich entwickelnden Dysbiose wurde in Lungen von Patienten mit chronischer obstruktiver Lungenerkrankung und gesunden Probanden untersucht.
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Zentrales Thema dieser Arbeit ist die Interaktion von Bakterien mit ihren Viren. Phagen mit einer lytischen Aktivität gegenüber Pseudomonas aeruginosa wurden isoliert und auf ihre Eignung als Therapeutika getestet. Die Beteiligung des bakteriellen Kommunikationsapparates Quorum Sensing an der Entstehung der antiviralen Resistenz wurde durch Experimente und Modellierungen überprüft. Zusätzlich zu dem Einfluss einzelner Viren wurde die Wirkung einer viralen Gemeinschaft auf ein Ökosystem analysie...
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