From low-throughput SSR genotyping to high-throughput SNP analyses of natural populations: validation of their application focused on non-invasive samples
Translated title:
Von der Niedrigdurchsatz-Genotypisierung von Mikrosatelliten hin zu Hochdurchsatz-SNP-Analysen natürlicher Populationen: Validierung ihrer Anwendung fokussiert auf non-invasives Probenmaterial
Efficient genetics tools are needed to provide information on the genetic constitution of endangered species. DNA quantification as a means of quality assessment of non-invasive genetic samples and a novel approach of SNP detection in non-model species called Random Amplicon Sequencing (RAMseq) were developed. These were validated during a non-invasive genetic census of the Eurasian otter (Lutra lutra) and performance of developed SNP markers in population genetic analyses was compared to that of established microsatellites.
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Efficient genetics tools are needed to provide information on the genetic constitution of endangered species. DNA quantification as a means of quality assessment of non-invasive genetic samples and a novel approach of SNP detection in non-model species called Random Amplicon Sequencing (RAMseq) were developed. These were validated during a non-invasive genetic census of the Eurasian otter (Lutra lutra) and performance of developed SNP markers in population genetic analyses was compared to that o...
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Translated abstract:
Effektive genetische Methoden werden benötigt, um Informationen über die genetische Konstitution bedrohter Arten zu erhalten. Die DNA-Quantifizierung zur Qualitätsbestimmung non-invasiver Proben und eine neue Methode zur Detektion von SNP Markern in nicht-Modelltierarten, Random Amplicon Sequencing (RAMseq), wurden entwickelt. Diese wurden während eines non-invasiven genetischen Zensus des Eurasischen Fischotters (Lutra lutra) validiert und die Effizienz der entwickelten SNP Marker mit der von etablierten Mikrosatelliten verglichen.
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Effektive genetische Methoden werden benötigt, um Informationen über die genetische Konstitution bedrohter Arten zu erhalten. Die DNA-Quantifizierung zur Qualitätsbestimmung non-invasiver Proben und eine neue Methode zur Detektion von SNP Markern in nicht-Modelltierarten, Random Amplicon Sequencing (RAMseq), wurden entwickelt. Diese wurden während eines non-invasiven genetischen Zensus des Eurasischen Fischotters (Lutra lutra) validiert und die Effizienz der entwickelten SNP Marker mit der von e...
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