Towards precision medicine in inflammatory skin diseases: Applying machine learning and statistics on spatial, single-cell, and bulk transcriptomics data
Übersetzter Titel:
Auf dem Weg zur Präzisionsmedizin bei entzündlichen Hauterkrankungen: Anwendung von Methoden des maschinellen Lernens und der Statistik auf räumliche, Einzelzell- und Bulk-Transkriptomdaten
Autor:
Hillig, Christina Katharina Luise
Jahr:
2025
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Computation, Information and Technology
Institution:
Lehrstuhl für Mathematische Modellierung biologischer Systeme (Prof. Theis)
Betreuer:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.)
Gutachter:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); List, Markus (Prof., Ph.D.)
Precision medicine enables targeted therapies, improving treatment efficacy for patients with non-communicable, chronic inflammatory skin diseases (ncISDs). Here, machine learning is applied to transcriptomics data to identify endotypes and classify them based on molecular markers, potentially associated with therapy response. Additionally, localised, cytokine-driven immune hotspots are identified in the epidermis. These findings contribute to the advancement of precision medicine in ncISDs.
Übersetzte Kurzfassung:
Die Präzisionsmedizin ermöglicht gezielte Therapien für nicht-übertragbare, chronisch-entzündliche Hauterkrankungen (ncISDs). Hier werden Methoden des maschinellen Lernens auf Transkriptomdaten angewendet, um Endotypen zu identifizieren und sie anhand molekularer Marker zu klassifizieren, die möglicherweise mit der Therapieantwort assoziiert sind. Zudem werden lokalisierte, Zytokin-gesteuerte Immun-Hotspots in der Epidermis identifiziert. Diese Ergebnisse fördern die Präzisionsmedizin in ncISDs.