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Original title:
Toehold-Mediated Strand Displacement in RNA-Based Molecular Switches and Gene Regulation
Translated title:
Toehold-vermittelte Strangverdrängung bei RNA-basierten molekularen Schaltern und Genregulation
Author:
Wang, Tianhe
Year:
2023
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Natural Sciences
Institution:
Lehrstuhl für Physik Synthetischer Biosysteme (Prof. Simmel)
Advisor:
Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.)
Referee:
Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.); Rief, Matthias (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
NAT Naturwissenschaften (allgemein)
Keywords:
Toehold Mediated strand displacement, Riboregulators, Gene regulation, Fluorescent light-up aptamer
Translated keywords:
Toehold-vermittelte Strangverdrängung, Riboregulatoren, Genregulation, Fluoreszierendes Leuchtaptamer
TUM classification:
PHY 820; CIT 900
Abstract:
This study explored the importance of strand displacement (SD) in gene regulation and biosensing. By investigating SD kinetics at the single-molecule level, sequence-dependent effects during SD are unveiled. These insights are leveraged in the design of riboregulators for gene regulation and novel RNA switches. Additionally, switchable fluorescent light-up aptamers controlled by trigger RNA or metabolites are engineered, offering potential applications in cost-effective RNA diagnosis.
Translated abstract:
Diese Studie untersuchte die Bedeutung der Strangverdrängung (Strang Displacement, SD) für die Genregulation und Biosensorik. Durch die Untersuchung der SD-Kinetik auf Einzelmolekülebene werden sequenzabhängige Effekte während der SD aufgedeckt. Diese Erkenntnisse werden bei der Entwicklung von Riboregulatoren für die Genregulation und neuartigen RNA-Schaltern genutzt. Darüber hinaus werden schaltbare fluoreszierende Leuchtaptamere entwickelt, die durch Trigger-RNA oder Metaboliten gesteuert wer...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1724905
Date of submission:
25.10.2023
Oral examination:
12.12.2023
File size:
24468246 bytes
Pages:
162
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20231212-1724905-1-8
Last change:
12.12.2024
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