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- Original title:
- The potential of a comparative genome and transcriptome approach for the discovery of valuable terpenoid molecules in Caryopteris x clandonensis
- Translated title:
- Das Potential eines vergleichenden genomischen und transkriptomischen Ansatzes zur Identifizierung von wertschöpfenden terpenoiden Verbindungen aus Caryopteris x clandonensis
- Author:
- Ritz, Manfred J.
- Year:
- 2023
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- TUM School of Natural Sciences
- Institution:
- Lehrstuhl für Synthetische Biotechnologie (Prof. Brück)
- Advisor:
- Brück, Thomas (Prof. Dr.)
- Referee:
- Mehlmer, Norbert (Priv.-Doz. Dr.); Feige, Matthias (Prof. Dr.); Teige, Markus (Priv.-Doz. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- CHE Chemie
- TUM classification:
- CIT 900
- Abstract:
- This thesis describes a bioinformatics approach for the pathway identification of valuable terpenoid molecules from Caryopteris x clandonensis. The extraction of RNA and genomic DNA is depicted, as well as consecutive sequencing. The bioinformatics analysis pipeline contains the assembly of a reference genome as well as consecutive mapping of transcribed reads. The thesis concludes with a functional annotation of putative novel proteins for terpene biosynthesis.
- Translated abstract:
- Diese Arbeit beschreibt die bioinformatische Herangehensweise zur Identifizierung des Synthesewegs von wertschöpfenden terpenoiden Verbindungen aus Caryopteris x clandonensis. Es wird die Extraktion der genomischen DNA und der transkribierten RNA beschrieben, sowie der nachfolgenden Sequenzierungen. Die bioinformatische Auswertung umfasst die Assemblierung eines Referenzgenoms, das Mapping der Transkriptsequenzen als auch die funktionelle Annotierung potenzieller terpenbildender Proteine.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1716492
- Date of submission:
- 26.07.2023
- Oral examination:
- 18.12.2023
- File size:
- 7765586 bytes
- Pages:
- 89
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20231218-1716492-1-6
- Last change:
- 08.03.2024
BibTeX