Environmental stress level - a mathematical modeling framework to investigate the influence of the microenvironment on tumor cell survival
Translated title:
Environmental Stress Level - ein mathematisches Modellierungskonzept zur Untersuchung des Einflusses des Mikroumfelds auf die Überlebensfähigkeit von Tumorzellen
Author:
Schönfeld, Sabrina
Year:
2023
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Computation, Information and Technology
Advisor:
Kuttler, Christina (Prof. Dr.)
Referee:
Kuttler, Christina (Prof. Dr.); Scarabosio, Laura (Prof. Dr.); Byrne, Helen (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
MAT Mathematik
TUM classification:
MAT 022
Abstract:
This thesis presents a novel mathematical modeling approach: the so-called environmental stress level (ESL). It describes the collective influence of the microenvironment on the viability of cells. We apply the ESL approach to different biological experiments. In combination with data-based parameter estimation using Bayesian inference, this allows for investigating the impact of nutrient supply, oxygen concentration, chemotherapeutic drugs and stiffness of the extracellular matrix on particular hepatocellular carcinoma cell lines.
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This thesis presents a novel mathematical modeling approach: the so-called environmental stress level (ESL). It describes the collective influence of the microenvironment on the viability of cells. We apply the ESL approach to different biological experiments. In combination with data-based parameter estimation using Bayesian inference, this allows for investigating the impact of nutrient supply, oxygen concentration, chemotherapeutic drugs and stiffness of the extracellular matrix on particular...
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Translated abstract:
In dieser Arbeit wird ein neuartiger mathematischer Modellierungsansatz vorgestellt: das sogenannte Environmental Stress Level (ESL). Es beschreibt den kollektiven Einfluss der Zellumgebung auf die Lebensfähigkeit von Zellen. Wir wenden den ESL-Ansatz auf verschiedene biologische Experimente an. Die Kombination mit datenbasierter Parameterschätzung mithilfe von Bayesscher Inferenz ermöglicht die Untersuchung des Einflusses von Nährstoffversorgung, Sauerstoffkonzentration, Chemotherapeutika und Steifigkeit der extrazellulären Matrix auf bestimmte hepatozelluläre Karzinom-Zelllinien.
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In dieser Arbeit wird ein neuartiger mathematischer Modellierungsansatz vorgestellt: das sogenannte Environmental Stress Level (ESL). Es beschreibt den kollektiven Einfluss der Zellumgebung auf die Lebensfähigkeit von Zellen. Wir wenden den ESL-Ansatz auf verschiedene biologische Experimente an. Die Kombination mit datenbasierter Parameterschätzung mithilfe von Bayesscher Inferenz ermöglicht die Untersuchung des Einflusses von Nährstoffversorgung, Sauerstoffkonzentration, Chemotherapeutika und S...
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