Identification of context-specific mRNA translation regulators in human cells by functional genomics
Translated title:
Identifizierung kontextspezifischer mRNA-Translationsregulatoren in menschlichen Zellen durch funktionelle Genomanalyse
Author:
Rodschinka, Geraldine Y. V.
Year:
2022
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Natural Sciences
Advisor:
Nedialkova, Danny (Prof. Dr.)
Referee:
Nedialkova, Danny (Prof. Dr.); Murray, Peter (Prof., Ph.D.); Stingele, Julian (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
CHE Chemie
TUM classification:
CHE 800
Abstract:
Compromised function of the mRNA translation machinery often leads to tissue-specific diseases. To understand the underlying mechanisms, we queried the importance of its components in proliferating and maturated human cells with CRISPRi screens. The loss of translation-dependent quality control factors leads to phenotypes that are strongly context-dependent. Furthermore, we identified new endogenous human mRNAs that are substrates of co-translational quality control pathways.
Translated abstract:
Eine gestörte Funktion der mRNA-Translationsmaschinerie führt häufig zu gewebespezifischen Krankheiten. Um die zugrundeliegenden Mechanismen zu verstehen, haben wir ihrer Komponenten in proliferierenden und adulten menschlichen Zellen mithilfe CRISPRi-Screens untersucht. Der Verlust von Qualitätskontrollfaktoren führt zu Phänotypen, die stark kontextabhängig sind. Darüber hinaus haben wir neue endogene mRNAs identifiziert, die Substrate dieser co-translationalen Qualitätskontrolle sind.
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