Identification of context-specific mRNA translation regulators in human cells by functional genomics
Übersetzter Titel:
Identifizierung kontextspezifischer mRNA-Translationsregulatoren in menschlichen Zellen durch funktionelle Genomanalyse
Autor:
Rodschinka, Geraldine Y. V.
Jahr:
2022
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Natural Sciences
Betreuer:
Nedialkova, Danny (Prof. Dr.)
Gutachter:
Nedialkova, Danny (Prof. Dr.); Murray, Peter (Prof., Ph.D.); Stingele, Julian (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
CHE Chemie
TU-Systematik:
CHE 800
Kurzfassung:
Compromised function of the mRNA translation machinery often leads to tissue-specific diseases. To understand the underlying mechanisms, we queried the importance of its components in proliferating and maturated human cells with CRISPRi screens. The loss of translation-dependent quality control factors leads to phenotypes that are strongly context-dependent. Furthermore, we identified new endogenous human mRNAs that are substrates of co-translational quality control pathways.
Übersetzte Kurzfassung:
Eine gestörte Funktion der mRNA-Translationsmaschinerie führt häufig zu gewebespezifischen Krankheiten. Um die zugrundeliegenden Mechanismen zu verstehen, haben wir ihrer Komponenten in proliferierenden und adulten menschlichen Zellen mithilfe CRISPRi-Screens untersucht. Der Verlust von Qualitätskontrollfaktoren führt zu Phänotypen, die stark kontextabhängig sind. Darüber hinaus haben wir neue endogene mRNAs identifiziert, die Substrate dieser co-translationalen Qualitätskontrolle sind.