Serine proteases are one type of enzymes that are able to cleave peptide bonds in proteins, in which serine serves as a nucleophile at the active site. Because of the important physiological role of serine proteases, they are popular targets for the antivirulence treatment of bacterial or viral infections. Understanding the reaction mechanism of serine proteases with inhibitors and main factors which influence the kinetics of reactions at a molecular level can help us to design novel drugs. In this dissertation, QM/MM calculations were performed to study the reaction mechanism and to calculate (free) energy barriers for two model systems of serine proteases.     «

Serine proteases are one type of enzymes that are able to cleave peptide bonds in proteins, in which serine serves as a nucleophile at the active site. Because of the important physiological role of serine proteases, they are popular targets for the antivirulence treatment of bacterial or viral infections. Understanding the reaction mechanism of serine proteases with inhibitors and main factors which influence the kinetics of reactions at a molecular level can help us to design novel drugs. In t...     »

Serinproteasen sind Enzyme, die Peptidbindungen in Proteinen spalten können, wobei Serin als Nukleophil am aktiven Zentrum dient. Aufgrund der wichtigen physiologischen Rolle der Serinproteasen sind sie beliebte Ziele für die Therapie von bakteriellen oder viralen Infektionen. Das Verständnis des Reaktionsmechanismus von Serinproteasen mit Inhibitoren und Hauptfaktoren, die die Kinetik der Reaktionen auf molekularer Ebene beeinflussen, kann uns bei der Entwicklung neuer Medikamente helfen. In dieser Dissertation wurden QM/MM-Rechnungen durchgeführt, um den Reaktionsmechanismus zu untersuchen und (freie) Energiebarrieren für zwei Modellsysteme von Serinproteasen zu berechnen.     «

Serinproteasen sind Enzyme, die Peptidbindungen in Proteinen spalten können, wobei Serin als Nukleophil am aktiven Zentrum dient. Aufgrund der wichtigen physiologischen Rolle der Serinproteasen sind sie beliebte Ziele für die Therapie von bakteriellen oder viralen Infektionen. Das Verständnis des Reaktionsmechanismus von Serinproteasen mit Inhibitoren und Hauptfaktoren, die die Kinetik der Reaktionen auf molekularer Ebene beeinflussen, kann uns bei der Entwicklung neuer Medikamente helfen. In di...     »