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Original title:
Mathematical Modeling and Pattern Formation for Bacterial Colonies
Translated title:
Mathematische Modellierung und Musterbildung für Bakterienkolonien
Author:
Oelker, Aenne Christine
Year:
2018
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Mathematik
Advisor:
Kuttler, Christina (Prof. Dr.)
Referee:
Kuttler, Christina (Prof. Dr.); Davidson, Fordyce A. (Prof., Ph.D.); Eberl, Hermann J. (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
MAT Mathematik
TUM classification:
MAT 022d
Abstract:
In this thesis, we study models for pattern formation in the Gram-positive bacterium Staphylococcus aureus. Starting from gene regulation mechanisms, we derive a reaction-diffusion model including quorum sensing and biofilm formation and demonstrate the potential of the model by finite element simulations. Furthermore we consider a front instability approach to determine the onset of pattern formation and investigate effects related to Darcy’s law using level set simulations.
Translated abstract:
In dieser Arbeit betrachten wir Modelle für Musterbildung im Gram-postiven Bakterium Staphylococcus aureus. Ausgehend von Genregulationsmechanismen leiten wir ein Reaktions-Diffusions-Modell mit Quorum Sensing und Biofilmbildung her und untersuchen es mit Finite Elemente Simulationen. Des Weiteren betrachten wir einen Front-Instabilitätsansatz, um zu bestimmen, wann Musterbildung einsetzt, und untersuchen mit Level Set Simulationen Effekte im Zusammenhang mit Darcy’s Gesetz.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1381797
Date of submission:
10.10.2017
Oral examination:
29.01.2018
File size:
33174159 bytes
Pages:
185
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20180129-1381797-1-0
Last change:
20.02.2018
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