Structure Formation of Biomolecules studied with Advanced Molecular Dynamics Simulations
Translated title:
Untersuchung der Strukturbildung von Biomolekülen mittels moderner Molekulardynamik Simulationen
Author:
Luitz, Manuel Patrick
Year:
2017
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Physik
Advisor:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
Referee:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Kaila, Ville (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
PHY Physik
TUM classification:
PHY 820d
Abstract:
Molecular dynamics simulations are a powerful tool to investigate dynamical and conformational properties of molecules at atomistic resolution. In this thesis the concepts of molecular dynamics simulations are introduced and modern advanced sampling techniques are reviewed. In multiple studies the underlying processes of structure formation in proteins and small peptides are then investigated with simulations and connected to experimental results.
Translated abstract:
Molekulardynamik Simulationen sind ein mächtiges Werkzeug um dynamische und strukturelle Eigenschaften von Molekülen auf atomarer Ebene zu untersuchen. Diese Arbeit beschreibt die Konzepte die hinter den Molekulardynamik Simulationen stehen und vermittelt einen Überblick über den aktuelle Stand der Technik. In mehreren Studien werden Strukturbildungsprozesse von Proteinen und kleinen Peptiden mittels Simulationen untersucht und mit experimentellen Ergebnissen verglichen.