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Original title:
Analysis of spatial chromatin organization and its evolutionary conservation
Translated title:
Analyse von räumlicher Chromatin-Organisation und ihrer evolutionären Konservierung
Author:
Kaufmann, Stefanie
Year:
2015
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.)
Referee:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.); Friedel, Caroline (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
Keywords:
Bioinformatics, Genome organization, Hi-C
Translated keywords:
Bioinformatik, Genomorganisation, Hi-C
Abstract:
Not only the DNA's base pair composition but also its spatial structure is relevant for gene expression. This work studies the dependency of the three-dimensional genome fold on linear features and rearrangements, as well as the structural similarities in human and mouse. We show that individual inter-chromosomal contacts are not conserved, though the linear genome composition and functional properties of its organization exhibit similarities.
Translated abstract:
Nicht nur die Basenpaarzusammensetzung der DNS, sondern auch ihre räumliche Struktur ist relevant für die Genexpression. Diese Arbeit befasst sich mit der Abhängigkeit der dreidimensionalen Genomfaltung von linearen Eigenschaften und Umordnungen, sowie den strukturellen Ähnlichkeiten in Mensch und Maus. Wir zeigen, dass individuelle inter-chromosomale Kontakte nicht konserviert sind, die lineare Genomzusammensetzung und funktionellen Eigenschaften ihrer Organisation aber große Ähnlichkeiten aufw...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1232114
Date of submission:
10.11.2014
Oral examination:
02.03.2015
File size:
26510197 bytes
Pages:
253
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20150302-1232114-0-9
Last change:
19.03.2015
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