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Original title:
Genomassemblierung komplexer Gräsergenome aus hoch-heterogenen Datensets.
Translated title:
Genomic assembly of highly complex grass genomes based on highly heterogenous datasets
Author:
Nussbaumer, Thomas
Year:
2015
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.)
Referee:
Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.); Schön, Chris-Carolin (Prof. Dr.)
Language:
de
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik
TUM classification:
BIO 110d
Abstract:
Für größere und hoch-repetitive Genome wie Gerste und Weizen wird eine physikalische Karte als Vorlage zur Assemblierung des gesamten Genoms erstellt. Methoden und Anwendungen werden dargestellt, die es erlaubten rund 80% der physikalischen Karte genetisch zu verankern. Auch wenn dieses Vorgehen für Getreidearten gezeigt wird, kann es für andere, ähnlich komplexe Genome angewandt werden, sofern Marker Karten, Hochdurchsatz-Sequenzdaten (WGS) und eine physikalische Karte vorliegen.
Translated abstract:
Larger and highly repetitive genomes require a physical map as template for assembling the entire genome. The present thesis gives insights into methods and applications on the basis of a physical map of larger plant genomes like barley and wheat, where 80% of the genome could be genetically positioned. Even so the approach is only shown for barley and wheat, the approach can be transferred also to other more complex genomes, supposed marker data, high-throughput data and a physical map are avai...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1231764
Date of submission:
13.10.2014
Oral examination:
29.06.2015
File size:
4911896 bytes
Pages:
124
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20150629-1231764-1-1
Last change:
21.07.2015
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