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Original title:
Computational Methods and Tools for Functional Analysis and Mining of High-throughput Proteomics Data
Translated title:
Bioinformatische Verfahren zur funktionalen Datenanalyse und Mining von High-throughput Proteomikdaten
Author:
Tyanova, Stefka
Year:
2013
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.)
Referee:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.); Mann, Matthias (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik; MED Medizin
Keywords:
data analysis, classification, large-scale proteomics data, phosphorylation, cancer, feature selection
Translated keywords:
Datenanalyse, Klassifizierung, großmaßstäblichen Proteomikdaten, Phosphorylierung, Krebs, Merkmalsreduktionsverfahren
TUM classification:
BIO 110d; BIO 220d; CHE 023d; CHE 808d; CHE 820d; MED 321d; MED 335d
Abstract:
The thesis provides contributions to the analysis of large-scale proteomics data. The first part investigates various properties of phosphorylation sites and demonstrates how these may facilitate and elucidate distinct functional roles. In the second part a classification framework is developed that supports various supervised learning methods and diverse feature selection techniques for clinical proteomics analysis. Its successful application to two oncoproteomics studies shows a great promise...     »
Translated abstract:
Diese Doktorarbeit befasst sich mit der Analyse von großmaßstäblichen Proteomikdaten. Der erste Teil stellt eine Studie verschiedener Eigenschaften von Phosphorylierungsstellen vor und zeigt auf, wie man diese zur Aufklärung von unterschiedlichen Funktionen nutzen kann. Im zweiten Teil wurde ein Klassifizierungsrahmen für klinische Proteomikdaten entwickelt, der eine Vielzahl von Merkmalsselektionsmethoden unterstützt. Die erfolgreiche Anwendung dieses Verfahrens auf zwei onko-proteomische Studi...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1145078
Date of submission:
15.05.2013
Oral examination:
19.08.2013
File size:
49303423 bytes
Pages:
165
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20130819-1145078-0-3
Last change:
01.10.2013
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