In-silico primer/probe design based on nucleic acid genome sequence data is of great interest in research and economy concerning microbial diagnostics. Facing the extremely fast growth of available genome sequence data, a scalable integrated system for primer/probe design has been developed within this thesis. It is based on a framework for efficient retrieval and management of sequence and annotation data from different heterogeneous sources and a new memory independent genome sequence index structure supporting fast non-heuristic oligonucleotide string matching.     «

In-silico primer/probe design based on nucleic acid genome sequence data is of great interest in research and economy concerning microbial diagnostics. Facing the extremely fast growth of available genome sequence data, a scalable integrated system for primer/probe design has been developed within this thesis. It is based on a framework for efficient retrieval and management of sequence and annotation data from different heterogeneous sources and a new memory independent genome sequence index st...     »

Rechnergestütztes Primer/Sonden-Design basierend auf Nukleinsäure Genomsequenzen ist von großem Interesse für die mikrobielle Diagnostik in Forschung und Wirtschaft. Mit Blick auf das extrem schnelle Wachstum der verfügbaren Genomsequenzen wurde ein skalierbares, integriertes System zum Primer/Sonden-Design entwickelt. Es basiert auf einem Framework zum effizienten Zugriff auf Genomdaten aus verschiedenen heterogenen Quellen sowie einer neuen speicherunabhängigen Genomsequenz-Indexstruktur, die schnelle nicht-heuristische Oligonukleotid-Suchen unterstützt.     «

Rechnergestütztes Primer/Sonden-Design basierend auf Nukleinsäure Genomsequenzen ist von großem Interesse für die mikrobielle Diagnostik in Forschung und Wirtschaft. Mit Blick auf das extrem schnelle Wachstum der verfügbaren Genomsequenzen wurde ein skalierbares, integriertes System zum Primer/Sonden-Design entwickelt. Es basiert auf einem Framework zum effizienten Zugriff auf Genomdaten aus verschiedenen heterogenen Quellen sowie einer neuen speicherunabhängigen Genomsequenz-Indexstruktur, die...     »