The study investigates the dynamics of γ-secretase using molecular dynamics simulations to understand the cleavage process of the C99 substrate. Three main interactions between γ-secretase and its substrate were identified, including the hydrophobic patch, the enzyme-substrate hybrid β-sheet, and an internal docking site. The study proposes a putative binding mode of a γ-secretase modulator and suggests a dual-binding mechanism of protein-protein stabilizer complexes. The molecular models can be applied to other membrane-embedded systems and proteases, providing insights into similar biological processes.     «

The study investigates the dynamics of γ-secretase using molecular dynamics simulations to understand the cleavage process of the C99 substrate. Three main interactions between γ-secretase and its substrate were identified, including the hydrophobic patch, the enzyme-substrate hybrid β-sheet, and an internal docking site. The study proposes a putative binding mode of a γ-secretase modulator and suggests a dual-binding mechanism of protein-protein stabilizer complexes. The molecular models can be...     »

In der Studie wird die Dynamik der γ-Sekretase mit Hilfe von Molekulardynamiksimulationen untersucht, um den Spaltungsprozess des C99-Substrats zu verstehen. Es wurden drei Hauptinteraktionen zwischen der γ-Sekretase und ihrem Substrat identifiziert, einschließlich des hydrophoben Patches, des hybriden β-Sheets des Enzyms und Substrats sowie einer internen Andockstelle. Die Studie schlägt einen möglichen Bindungsmodus eines γ-Sekretase-Modulators und einen dualen Bindungsmechanismus von Protein-Protein-Stabilisatoren vor. Die molekularen Modelle können auf andere membranverankerte Systeme und Proteasen übertragbar sein und Einblicke in ähnliche biologische Prozesse bieten.     «

In der Studie wird die Dynamik der γ-Sekretase mit Hilfe von Molekulardynamiksimulationen untersucht, um den Spaltungsprozess des C99-Substrats zu verstehen. Es wurden drei Hauptinteraktionen zwischen der γ-Sekretase und ihrem Substrat identifiziert, einschließlich des hydrophoben Patches, des hybriden β-Sheets des Enzyms und Substrats sowie einer internen Andockstelle. Die Studie schlägt einen möglichen Bindungsmodus eines γ-Sekretase-Modulators und einen dualen Bindungsmechanismus von Protein-...     »