Die zentrale Hochdurchsatztechnologie, um das Proteom im grossen Stil zu erforschen, ist Massenspektrometrie basierte Proteomik. Angesichts der Interpretation der daraus resultierenden experimentellen Daten, spielt Computational Proteomics eine entscheidende Rolle. Das Ziel dieser Arbeit war es, neue Ansätze für die Datenbanksuche zu entwickeln, im Besonderen Aspekte des theoretischen Suchraums zu verbessern und Möglichkeiten die Ergebnisse zu bewerten. Die Arbeit konzentriert sich auf den Konstruktionsprozess und die Zusammensetzung von Sequenzdatenbanken und die anschließende statistische Validierung von Peptididentifikationen und Lokalisierung von Phosphorylierungsstellen.     «

Die zentrale Hochdurchsatztechnologie, um das Proteom im grossen Stil zu erforschen, ist Massenspektrometrie basierte Proteomik. Angesichts der Interpretation der daraus resultierenden experimentellen Daten, spielt Computational Proteomics eine entscheidende Rolle. Das Ziel dieser Arbeit war es, neue Ansätze für die Datenbanksuche zu entwickeln, im Besonderen Aspekte des theoretischen Suchraums zu verbessern und Möglichkeiten die Ergebnisse zu bewerten. Die Arbeit konzentriert sich auf den Konst...     »

The key high-throughput technology to interrogate the proteome on a large scale is mass spectrometry based proteomics. To interpret the resulting experimental data, computational proteomics plays a critical role. The objective of this thesis was to develop novel approaches for database searching, in particular improve aspects of the theoretical search space and means to validate the results. The thesis concentrates on the construction process and composition of sequence databases and the subsequent statistical validation of peptide identifications and phosphorylation site localization.     «

The key high-throughput technology to interrogate the proteome on a large scale is mass spectrometry based proteomics. To interpret the resulting experimental data, computational proteomics plays a critical role. The objective of this thesis was to develop novel approaches for database searching, in particular improve aspects of the theoretical search space and means to validate the results. The thesis concentrates on the construction process and composition of sequence databases and the subsequ...     »