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- Original title:
- Bioinformatic analysis of integrated Arabidopsis thaliana protein interaction networks
- Translated title:
- Bioinformatische Analyse von integrierten Arabidopsis thaliana Protein-Interaktionsnetzwerken
- Author:
- Altmann, Stefan
- Year:
- 2019
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
- Advisor:
- Schwechheimer, Claus (Prof. Dr.)
- Referee:
- Schwechheimer, Claus (Prof. Dr.); Falter-Braun, Pascal (Prof. Dr.); Rattei, Thomas (Prof. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- BIO Biowissenschaften
- TUM classification:
- BIO 400d
- Abstract:
- Protein-protein interactions are involved in most biological processes and form large networks. In this thesis, the bioinformatic analyses of two systematic Arabidopsis thaliana protein interaction networks are described. The analysis of the network of proteins involved in phytohormone signaling revealed a hierarchical topology, which reflected biological processes. Moreover, a dense interconnectedness between distinct pathways was found. The examination of interactions between effector proteins of three pathogens and Arabidopsis host proteins revealed a convergence of effector proteins on common host proteins.
- Translated abstract:
- Protein-Protein-Interaktionen sind an den meisten biologischen Prozessen beteiligt und bilden große Netzwerke. In dieser Arbeit werden die bioinformatischen Analysen von zwei systematischen Arabidopsis thaliana Protein-Interaktionsnetzwerken beschrieben. Die Analyse des Netzwerks von Proteinen, die an der Phytohormon-Signalübertragung beteiligt sind, ergab eine hierarchische Topologie, die biologische Prozesse widerspiegelte. Darüber hinaus wurde eine dichte Vernetzung zwischen verschiedenen Signalwegen festgestellt. Die Untersuchung der Interaktionen zwischen Effektorproteinen von drei Krankheitserregern und Arabidopsis-Wirtsproteinen ergab eine Konvergenz von Effektorproteinen auf gemeinsame Wirtsproteine.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1510106
- Date of submission:
- 27.06.2019
- Oral examination:
- 13.11.2019
- File size:
- 9687265 bytes
- Pages:
- 259
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20191113-1510106-1-4
- Last change:
- 01.11.2021
BibTeX