mediaTUM
Universitätsbibliothek
Technische Universität München
User: Guest
Login
de
en
mediaTUM Content
University Bibliography
2024
(3333)
2023
(7640)
2022
(8653)
2021
(8905)
2020
(8177)
Fakultäten
(7554)
Architektur
(110)
Bau Geo Umwelt
(582)
Chemie
(180)
Elektrotechnik und Informationstechnik
(1107)
Informatik
(489)
Luftfahrt, Raumfahrt und Geodäsie
(471)
Maschinenwesen
(978)
Mathematik
(129)
Medizin
(859)
Physik
(255)
Sport- und Gesundheitswissenschaften
(273)
TUM School of Education
(171)
TUM School of Governance
(138)
Wirtschaftswissenschaften
(422)
Wissenschaftszentrum Weihenstephan
(1274)
Arbeitsgruppe Proteomik (Prof. Görg em.)
Assistant Professorship Biothermodynamik (Prof. Mincheva)
(21)
Assistant Professorship Feststoffverfahrenstechnik (Prof. N.N.)
Assistant Professorship Fluiddynamik komplexer Bios (Prof. Germann)
(1)
Assistant Professorship Forstliche Verfahrenstechnik (N.N.)
(1)
Bayerisches Zentrum für Biomolekulare Massenspektrometrie (BayBioMS)
(33)
Chair of Public Health Nutrition (N.N.)
Forschungszentrum Weihenstephan für Brau- und Lebensmittelqualität (Prof. Jacob)
(2)
Junior-Professur für Funktionelle Aquatische Ökologie und Fischbiologie (Prof. Geist)
(2)
Lehrstuhl für Biotechnologie der Nutztiere (Prof. Schnieke)
(16)
Lehrstuhl für Agrar- und Ernährungswirtschaft (Prof. Buchenrieder komm.)
Lehrstuhl für Agrarsystemtechnik (Prof. Wenzel komm.)
(29)
Lehrstuhl für Allgemeine Lebensmitteltechnologie (Prof. Engel)
(1)
Lehrstuhl für Analytische Lebensmittelchemie (Prof. Rychlik)
(51)
Lehrstuhl für Aquatische Systembiologie - Weihenstephan (Prof. Geist)
(26)
Lehrstuhl für Atmosphärische Umweltforschung (Prof. Schmid Hans-Peter)
Lehrstuhl für Bioanalytik (Prof. Küster)
(26)
Lehrstuhl für Biochemische Pflanzenpathologie (Prof. Durner)
Lehrstuhl für Biofunktionalität der Lebensmittel (Prof. Haller)
(11)
Lehrstuhl für Biogene Polymere (Prof. Zollfrank)
Lehrstuhl für Biologische Chemie (Prof. Skerra)
(16)
Lehrstuhl für Bodenkunde (Prof. Kögel-Knabner)
(56)
Lehrstuhl für Bodenökologie (N.N.)
Lehrstuhl für Botanik (Prof. Grill)
(9)
Lehrstuhl für Brau- und Getränketechnologie (Prof. Becker)
(62)
Lehrstuhl für Chemie biogener Rohstoffe (Prof. Sieber)
Lehrstuhl für Chemie der Biopolymere (Prof. Langosch)
(5)
Lehrstuhl für Chemisch-technische Analyse und Chemische Lebensmitteltechnologie (N.N.)
Lehrstuhl für Entwicklungsgenetik (Prof. Wurst)
(6)
Lehrstuhl für Ernährungsphysiologie (Prof. Klingenspor komm.)
Lehrstuhl für Experimentelle Bioinformatik (Prof. Baumbach)
(20)
Lehrstuhl für Experimentelle Genetik (Prof. Hrabé de Angelis)
(97)
Lehrstuhl für Forstliche Arbeitswissenschaft und Angewandte Informatik (komm. Prof. Mosandl)
Lehrstuhl für Genetik (N.N.)
Lehrstuhl für Genomorientierte Bioinformatik (Prof. Frischmann komm.)
(18)
Lehrstuhl für Grundwasserökologie (N.N.)
Lehrstuhl für Grünlandlehre (Prof. Schnyder)
(6)
Lehrstuhl für Holzkunde und Holztechnik (Prof. Wegener)
(10)
Lehrstuhl für Humanbiologie (Prof. Schemann)
(1)
Lehrstuhl für Landschaftsökologie (Prof. Trepl)
(41)
Lehrstuhl für Lebensmittelchemie und Molekulare Sensorik (Prof. Hofmann)
(45)
Lehrstuhl für Lebensmittelverfahrenstechnik und Molekulartechnik (Prof. Kulozik)
(36)
Lehrstuhl für Lebensmittelverpackungstechnik (Prof. Langowski)
(1)
Lehrstuhl für Mikrobielle Ökologie (Prof. Scherer)
(16)
Lehrstuhl für Mikrobiologie (Prof. Liebl)
(11)
Lehrstuhl für Molekulare Ernährungsmedizin (Prof. Klingenspor)
(16)
Lehrstuhl für Pflanzenernährung (Prof. Schmidhalter)
(13)
Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung (Prof. Schön)
(6)
Lehrstuhl für Physiologie (Prof. Meyer)
(24)
Lehrstuhl für Phytopathologie (Prof. Hückelhoven)
(14)
Lehrstuhl für Strategie und Management der Landschaftsentwicklung (Prof. Zehlius-Eckert komm.)
(25)
Lehrstuhl für Systembiologie der Pflanzen (Prof. Schwechheimer)
(5)
Lehrstuhl für Systemverfahrenstechnik (Prof. Wierschem komm)
(46)
Lehrstuhl für Technische Mikrobiologie (Prof. Vogel)
(29)
Lehrstuhl für Tierernährung (Prof. Schnieke, komm.)
(28)
Lehrstuhl für Tierhygiene (Prof. Bauer)
(1)
Lehrstuhl für Tierzucht (Prof. Fries)
Lehrstuhl für Tierökologie (komm. Prof. Gerstmeier)
Lehrstuhl für Vegetationsökologie (Prof. Pfadenhauer)
(35)
Lehrstuhl für Verfahrenstechnik disperser Systeme (N.N.)
Lehrstuhl für Waldbau (N.N.)
(3)
Lehrstuhl für Waldwachstumskunde (Prof. Pretzsch)
(38)
Lehrstuhl für Zoologie (Prof. Luksch)
(10)
Lehrstuhl für Ökologischen Landbau und Pflanzenbausysteme (Prof. Hülsbergen)
(22)
Lehrstuhl für Ökophysiologie der Pflanzen (Prof. Kollmann komm.)
(6)
Lehrstuhl für Ökosystemdynamik und Waldmanagement in Gebirgslandschaften (Prof. Seidl)
(35)
Nachwuchsforschungsgruppe LipiTUM - A Computational Platform for Lipidomics and Lipotyping in Systems Medicine
(1)
Professur für Agrarmechatronik (Prof. Oksanen)
Professur für Angewandte Holzbiologie (N.N.)
Professur für Biodiversität der Pflanzen (Prof. Schäfer)
(7)
Professur für Bioinformatik (Prof. Frischmann)
(20)
Professur für Biotechnologie der Naturstoffe (Prof. Schwab)
(22)
Professur für Biotechnologie der Reproduktion (Prof. Schusser)
(4)
Professur für Biotechnologie gartenbaulicher Kulturen (Prof. Poppenberger)
(4)
Professur für Computational Neurosciences (Prof. Gjorgjieva)
Professur für Crop Physiology (Prof. Bienert)
(1)
Professur für Entwicklungsbiologie der Pflanzen (Prof. Schneitz)
(4)
Professur für Forstgenetik (N.N.)
Professur für Geobotanik (N.N.)
Professur für Geomorphologie und Bodenkunde (Prof. Völkel)
(2)
Professur für Holztechnologie (Prof. van de Kuilen)
(19)
Professur für Intestinal Microbiome (Prof. Hall)
(6)
Professur für Land Surface-Atmosphere Interactions (Prof. Rammig)
(26)
Professur für Landschaftsökologie (Prof. Schröder)
Professur für Limnologie (Prof. Melzer)
Professur für Metabolic Programming (Prof. Uhlenhaut)
(18)
Professur für Neuronale Kontrolle des Metabolismus (Prof. N.N.)
(4)
Professur für Obstbau (Prof. Schwab komm.)
(2)
Professur für Pathologie der Waldbäume (N.N.)
Professur für Peptidbiochemie (Prof. Kapurniotu)
(7)
Professur für Pflanzengenetik (Prof. Gutjahr)
(6)
Professur für Pilz-Biotechnologie in der Holzwissenschaft (Prof. Benz)
(9)
Professur für Plant-Insect Interaction (Prof. Leonhardt)
(11)
Professur für Populations-Epigenetik und Epigenomik (Prof. Johannes)
(5)
Professur für Populationsgenetik (Prof. Tellier)
(3)
Professur für Precision Agriculture (Prof. Yu)
(2)
Professur für Protein Modelling (Prof. Antes)
(4)
Professur für Regenerative Energiesysteme (Prof. Gaderer)
Professur für Single Cell Genomics (Prof. Treutlein)
Professur für Technik im Gartenbau und Weinbau (Prof. Hückelhoven komm.)
Professur für Urbane Produktive Ökosysteme (Prof. Egerer)
(13)
Professur für Wald- und Agroforstsysteme (Prof. Annighöfer)
(5)
Professur für Waldernährung und Wasserhaushalt (Prof. Göttlein)
(6)
Professur für Waldinventur und nachhaltige Nutzung (Prof. Knoke)
(26)
Professur für Ökotoxikologie (N.N.)
Professur Ökoklimatologie (Prof. Menzel)
(17)
TUM Campus Straubing für Biotechnologie und Nachhaltigkeit
(122)
Integrated Research Centers
(329)
Zentrale Einrichtungen
(294)
2019
(8872)
2018
(8702)
2017
(8694)
2016
(8828)
2015
(8221)
2014
(7134)
2013
(6748)
2012
(5780)
2011
(5563)
2010
(5418)
2009
(4595)
2008
(4104)
1989 - 2007
Electronic Examination Papers
Open Access Publikationen
Research Data
TUM.University Press
Collections
Projects
Institutions
mediaTUM Gesamtbestand
Hochschulbibliographie
2020
Fakultäten
Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Bayerisches Zentrum für Biomolekulare Massenspektrometrie (BayBioMS)
Back
Back to start of result list
Permanent link for displayed object
Document type:
Zeitschriftenaufsatz
Author(s):
Ku, Xin; Sun, Qiangling; Zhu, Lei; Gu, Zhitao; Han, Yuchen; Xu, Ning; Meng, Chen; Yang, Xiaohua; Yan, Wei; Fang, Wentao
Title:
Deciphering tissue‐based proteome signatures revealed novel subtyping and prognostic markers for thymic epithelial tumors
Abstract:
Thymic epithelial tumors (TETs) belong to a group of tumors that rarely occur, but have unresolved mechanisms and heterogeneous clinical behaviors. Current care of TET patients demands biomarkers of high sensitivity and specificity for accurate histological classification and prognosis management. In this study, 134 fresh-frozen tissue samples (84 tumor, 40 tumor-adjacent and 10 normal thymus) were recruited to generate a quantitative and systematic view of proteomic landscape of TETs. Among them, 90 samples were analyzed by data-independent acquisition mass spectrometry (DIA-MS) leading to discovery of novel classifying molecules among different TET subtypes. The correlation between clinical outcome and the identified molecules was probed and the prioritized proteins of interest were further validated on the remaining samples (n=44) via parallel-reaction monitoring (PRM) as well as immunohistochemical and confocal imaging analysis. In particular two proteins, the cellular mRNA deadenylase CCR4 (carbon catabolite repressor 4)-NOT (Negative on TATA) complex subunit 2/9 (CNOT2/9) and the serine hydroxymethyltransferase that catalyzes the reversible interconversions of serine and glycine (SHMT1) were found at dramatic low levels in the thymic epithelia of more malignant subtype, thymic squamous cell carcinoma (TSCC). Interestingly, the mRNA levels of these two genes were shown to be closely correlated with prognosis of the TET patients. These results extended the existing human tissue proteome atlas and allowed us to identify several new protein classifiers for TET subtyping. Newly identified subtyping and prognosis markers, CNOT2/9 and SHMT1, will expand current diagnostic arsenal in terms of higher specificity and prognostic insights for TET diagnosis and managment. © 2020 The Authors. Published by FEBS Press and John Wiley & Sons Ltd.
Keywords:
BayBioMS; Molecular Profiling; Protein classifiers; Targeted Proteomics; Thymic epithelial tumors; WHO classification
Journal title:
Molecular Oncology
Year:
2020
Fulltext / DOI:
doi:10.1002/1878-0261.12642
Publisher:
Wiley
E-ISSN:
1574-78911878-0261
Date of publication:
22.01.2020
BibTeX
Occurrences:
mediaTUM Gesamtbestand
Hochschulbibliographie
2020
Fakultäten
Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Bayerisches Zentrum für Biomolekulare Massenspektrometrie (BayBioMS)
mediaTUM Gesamtbestand
Einrichtungen
Schools
TUM School of Life Sciences
Zentren
Bayerisches Zentrum für Biomolekulare Massenspektrometrie (BayBioMS)
Jahr
2020