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- Original title:
- Tissue-specific gene (and protein) expression and its effects on protein-protein interaction networks in cancer and other complex diseases.
- Translated title:
- Gewebespezifische Gen- (und Protein-) Expression und ihre Auswirkung auf die Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke in Krebs und anderen komplexen Krankheiten.
- Author:
- Kataka, Evans
- Year:
- 2020
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
- Advisor:
- Frishman, Dmitrij (Prof. Dr.)
- Referee:
- Frishman, Dmitrij (Prof. Dr.); Cox, Jürgen (Prof., Ph.D.)
- Language:
- en
- Subject group:
- BIO Biowissenschaften
- Keywords:
- Isoform switching, edgetic perturbations, biomarker discovery, cancer, network rewiring, cell type specific protein (mRNA) expression
- Translated keywords:
- Isoform switching, edgetische Störungen, Entdeckung von Biomarkern, Krebs, Netzwerk-Neuverdrahtung, Expression von zelltypspezifischem Protein (mRNA).
- TUM classification:
- BIO 110d
- Abstract:
- The use of high throughput next-generation sequencing data advanced our understanding of cancer. Omics data integration with network data (protein-protein interaction networks, PPINs) is a novel way of studying diseases to find biomarkers. PPINs are vital in our understanding of the behavior of diseases and in the development of new therapies. This thesis aimed at identifying how differential isoform expression between cancer and healthy states may result in edgetic perturbations in cancer.
- Translated abstract:
- Als neuartige Methode zur Untersuchung komplexer Krankheiten wurde die Integration von Sequenzierungsdaten der nächsten Generation und Omics Daten mit Protein-Protein-Interatkionsnetzwerken (PPINs) vorgeschlagen Biomarker zu identifizieren. PPINs spielen eine entscheidende Rolle für unser Verständnis Krankheiten, sowie bei der Entwicklung neuer Therapien. Diese Arbeit zielte darauf ab, herauszufinden wie unterschiedliche Isoformausprägungen zu randständigen Störungen bei Krebs führen können.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1544278
- Date of submission:
- 29.04.2020
- Oral examination:
- 26.10.2020
- File size:
- 8949885 bytes
- Pages:
- 179
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20200909-1544278-1-3
- Last change:
- 19.11.2020
BibTeX