Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Antes, Iris (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
PHY Physik
Keywords:
DNA repair damage MD molecular dynamics simulation
Translated keywords:
DNA Reparatur Schaden MD molecular dynamics Simulation
TUM classification:
PHY 820d
Abstract:
DNA is regularly damaged in all forms of life. One of most dangerous damaging agents is UV light. The mechanism of the recognition of these lesions through repair proteins has been poorly understood. The large excess of undamaged bases makes the recognition demanding. In my thesis this mechanism was studied by Molecular Dynamics Simulation by extending the standard methodology. It was discovered that the key part of the recognition occurs before the actual repair procedure.
Translated abstract:
DNA wird in allen Formen des Lebens regelmäßig durch UV-Licht beschädigt. Der Erkennungsmechanismus dieser Läsionen durch Reparaturproteine ist bisher nicht gut verstanden. Die große Anzahl an nicht beschädigten Basen macht deren Auffindung besonders schwierig. In meiner Thesis wurde dieser Mechanismus mittels Molekulardynamik-Simulationen untersucht, unter Erweiterung der Standard-Methoden. Es wurde herausgefunden, dass ein großer Teil der Erkennung vor der eigentlichen Reparatur stattfindet.