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Original title:
isobarQuant: A software tool for the processing, analysis and quantification of Mass Spectrometry Data
Translated title:
isobarQuant: Ein Programm zur Verarbeitung, Analyse und Quantifizierung von Massenspektrometriedaten
Author:
Mathieson, Toby
Year:
2020
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
Referee:
Küster, Bernhard (Prof. Dr.); Fufezan, Christian (Priv.-Doz. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
Keywords:
Proteomics, software, quantification, bioinformatics
Translated keywords:
Proteomik, Quantifizierung, Bioinformatik, Software
TUM classification:
CHE 828d
Abstract:
Quantitative proteomics requires methods that are accurate and precise. While software tools to process mass spectrometry data exist, they are often limited to only part of the complete analysis. Presented here is isobarQuant, a simple tool that implements new methods to perform accurate and precise MS1 and MS2 quantification. It also combines raw data and its interpretation into a single, easily accessible HDF5-indexed file. This open-source solution enables researchers to answer questions that...     »
Translated abstract:
Quantitative Proteomik erfordert Methoden, die akkurat und präzise sind. Es gibt viele Programme zur Verarbeitung von Massenspektrometriedaten, diese beschränken sich jedoch häufig nur auf einen Teil der vollständigen Analyse. Hier wird isobarQuant vorgestellt, ein leicht-bedienbares Programm, das eine akkurate und präzise MS1- und MS2-Quantifizierung ermoeglicht. Außerdem werden Rohdaten und ihre Interpretation in einer einzigen, leicht zugänglichen HDF5-indizierten Datei kombiniert. Diese Open...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1542350
Date of submission:
27.04.2020
Oral examination:
15.10.2020
File size:
83911888 bytes
Pages:
183
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20201015-1542350-1-4
Last change:
30.11.2020
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