Spastin, a medically relevant AAA ATPase, is able to sever microtubules. In its active form, it assembles into a hexameric ring complex. The present thesis studies kinetic models describing oligomerization pathways, and allosteric coupling of subunits using computer simulations. A minimal reaction scheme, and a two-state activity model could be found that describe experimental data and the inhibition by mutants quantitatively.
Übersetzte Kurzfassung:
Spastin, eine medizinisch relevante AAA ATPase, ist in der Lage, Mikrotubuli zu zertrennen. In seiner aktiven Form liegt es als Sechser-Ring vor. Die vorliegende Arbeit untersucht kinetische Modelle des Oligomerisierungswegs und der allosterischen Kopplung der Untereinheiten mittels Computersimulationen. Es konnte ein minimales Reaktionsschema, sowie ein Zwei-Stufen-Aktivitätsmodell gefunden werden, das die experimentellen Daten beschreibt und die Inhibition durch Mutanten quantitativ erklärt.