Nach gemeinsamer bakterieller Expression und Reinigung wurde ein funktionell aktiver und Trichostatin-A (TSA)-sensitiver heterotrimerer Hda1 Komplex erhalten. Eine Charakterisierung der Interaktion des HDAC Komplexes mit sowohl einzelsträngiger als auch doppelsträngiger DNA identifizierte die N-terminalen Hälften von scHda2p und scHda3p als Bindemoleküle. Durch Röntgenstrahlkristallographie wurde eine hochauflösende Struktur der scHda3p DNA-Bindedomain (DBD3) aufgeklärt. In der hier beschriebenen Studie wurde die Kristallstruktur von Sap5 im Komplex mit Pepstatin-A mit einer Auflösung von 2.5Å erfolgreich aufgeklärt. Dies ermöglicht einen Vergleich sowohl der strukturellen Details als auch des Mechanismus der Inhibitorbindung unter den verschiedenen Mitgliedern der Untergruppe Sap4-6.
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