Charting the neural organoid landscape and the impact of glucocorticoids on human brain development through single-cell genomics

Dony, Leander Paul Friedrich

Mathematics

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Original title:: Charting the neural organoid landscape and the impact of glucocorticoids on human brain development through single-cell genomics
Translated title:: Kartierung von neuralen Organoiden und des Effekts von Glukokortikoiden auf die menschliche Gehirnentwicklung mittels Einzelzell-Genomik
Author:: Dony, Leander Paul Friedrich
Year:: 2025
Document type:: Dissertation
Faculty/School:: TUM School of Computation, Information and Technology
Institution:: Lehrstuhl für Mathematische Modellierung biologischer Systeme (Prof. Theis)
Advisor:: Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Binder, Elisabeth B. (Prof. Dr. Dr.)
Referee:: Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Binder, Elisabeth B. (Prof. Dr. Dr.); Meissner, Alexander (Prof. Dr.)
Language:: en
Subject group:: BIO Biowissenschaften
Keywords:: single-cell genomics, neurodevelopment, neural organoids, data curation, atlas building, glucocorticoids, machine learning
Translated keywords:: Einzelzell-Genomik, Gehirnentwicklung, neuronale Organoide, Datenkuratierung, Glukokortikoide, maschinelles Lernen
TUM classification:: BIO 110; MAT 022
Abstract:: Disruptions in fetal brain development can lead to disease. Here, I aim to improve our understanding of neural organoids as a model of neurodevelopment and use them to study the mechanisms underlying the development of psychiatric diseases. For this, I introduce a tool for single-cell genomics data curation. I then use this tool to build the Human Neural Organoid Cell Atlas. This atlas provides context for my consequent analysis of the effect of glucocorticoids on human brain development.
Translated abstract:: Störungen in der Gehirnentwicklung können zu Krankheiten führen. Hier untersuche ich neurale Organoide als Modell der Gehirnentwicklung und nutze sie, um Mechanismen der Entstehung psychiatrischer Krankheiten zu beleuchten. Dafür stelle ich ein Tool für die Zusammenstellung von Zellatlanten vor. Anschließend verwende ich dieses, um den Human Neural Organoid Cell Atlas zu erstellen. Dieser kontextualisiert meine anschließende Analyse der Wirkung von Glukokortikoiden auf die Gehirnentwicklung.
WWW:: https://mediatum.ub.tum.de/?id=1738262
Date of submission:: 27.03.2024
Oral examination:: 18.02.2025
File size:: 32847355 bytes
Pages:: 183
Urn (citeable URL):: https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bvb:91-diss-20250218-1738262-0-4
Last change:: 07.03.2025
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