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Original title:
Programming Dynamic Bacterial Behaviour with CRISPRi-Based Genetic Circuits
Translated title:
Programmierung des dynamischen Verhaltens von Bakterien mit genetischen Netzwerken auf CRISPRi Basis
Author:
Henningsen, John
Year:
2021
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Physik
Advisor:
Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.)
Referee:
Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.); Gerland, Ulrich (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
PHY Physik
TUM classification:
PHY 820; CIT 900
Abstract:
In this work, we integrate CRISPR interference into genetic circuits to explore novel ways to connect them with native genes and the environment of the host. The stability and effect on growth of a bacterial oscillator is studied in sub-micron scale microfluidic chips. The potential of the oscillator as a controller for temporal gene expression programs is quantified with an information theoretic approach. By targeting the host metabolism, a CRISPRi circuit is coupled to the growth environment....     »
Translated abstract:
In dieser Arbeit integrieren wir die CRISPR-interference in künstliche genetische Netzwerke, um sie mit nativen Genen und der Umgebung des Wirts zu verbinden. Die Stabilität und die Auswirkungen auf das Wachstum eines bakteriellen Oszillators werden in Mikrofluidik Chips untersucht. Das Potenzial des Oszillators als Controller für zeitliche Genexpressionsprogramme wird mit einem informationstheoretischen Ansatz quantifiziert. Durch gezielte Eingriffe in den Wirtsstoffwechsel wird ein CRISPRi-Ne...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1633947
Date of submission:
23.11.2021
Oral examination:
17.12.2021
File size:
12688784 bytes
Pages:
128
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20211217-1633947-1-2
Last change:
17.01.2022
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