Analysing the role of human endogenous retrovirus, HERV-K(HML-2), on cortical neuron differentiation

Padmanabhan Nair, Vidya

Vidya Padmanabhan Nair

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Original title:: Analysing the role of human endogenous retrovirus, HERV-K(HML-2), on cortical neuron differentiation
Translated title:: Analyse der Rolle des humanen endogenen Retrovirus, HERV-K(HML-2), auf die Differenzierung kortikaler Neuronen
Author:: Padmanabhan Nair, Vidya
Year:: 2022
Document type:: Dissertation
Faculty/School:: Fakultät für Medizin
Advisor:: Protzer, Ulrike (Prof. Dr.)
Referee:: Protzer, Ulrike (Prof. Dr.); Wurst, Wolfgang (Prof. Dr.); Schusser, Benjamin (Prof. Dr.)
Language:: en
Subject group:: NAT Naturwissenschaften (allgemein)
Keywords:: HERVs, cortical neuron differentiation, neurodegenerative diseases
TUM classification:: BIO 300; MED 403
Abstract:: HERVs count for about 8% of our genome. Here, we generated a CRISPRa and CRISPRi system in human stem cells targeting HERV-K(HML2) to study their role in neuronal differentiation. Transcriptional activation of HERV-K(HML-2) changed morphology and functionality of cortical neurons as well as patterning of brain layers in forebrain organoids. A whole genome RNA seq analysis revealed enrichment of neuron-related genes. These results show that HERV-K(HML-2) elements affect cortical neuronal development which could affect several neuron related disorders. «
HERVs count for about 8% of our genome. Here, we generated a CRISPRa and CRISPRi system in human stem cells targeting HERV-K(HML2) to study their role in neuronal differentiation. Transcriptional activation of HERV-K(HML-2) changed morphology and functionality of cortical neurons as well as patterning of brain layers in forebrain organoids. A whole genome RNA seq analysis revealed enrichment of neuron-related genes. These results show that HERV-K(HML-2) elements affect cortical neuronal developm... »
Translated abstract:: Unser Genom besteht zu 8% aus HERVs. Zur Untersuchung der Rolle von HERV-K(HML2) bei neuronaler Differenzierung generierten wir ein CRISPRa- und CRISPRi-System in menschlichen Stammzellen. Die transkriptionelle Aktivierung von HERV-K(HML-2) veränderte die funktionelle Morphologie von kortikalen Neuronen und die zelluläre Schichtung in Vorderhirn-Organoiden. Transkriptom-Analysen zeigten eine Anreicherung von Neuronen-verwandten Genen. Somit beeinflussen HERV-K(HML-2)-Elemente die kortikale neuronale Entwicklung, was auf neuronale Krankheiten wirken könnte. «
Unser Genom besteht zu 8% aus HERVs. Zur Untersuchung der Rolle von HERV-K(HML2) bei neuronaler Differenzierung generierten wir ein CRISPRa- und CRISPRi-System in menschlichen Stammzellen. Die transkriptionelle Aktivierung von HERV-K(HML-2) veränderte die funktionelle Morphologie von kortikalen Neuronen und die zelluläre Schichtung in Vorderhirn-Organoiden. Transkriptom-Analysen zeigten eine Anreicherung von Neuronen-verwandten Genen. Somit beeinflussen HERV-K(HML-2)-Elemente die kortikale neuro... »
WWW:: https://mediatum.ub.tum.de/?id=1596436
Date of submission:: 23.02.2021
Oral examination:: 14.03.2022
File size:: 37946306 bytes
Pages:: 140
Urn (citeable URL):: https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20220314-1596436-1-7
Last change:: 17.05.2022
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