In this dissertation, the molecular mechanism of active ion transport across a biological membrane was investigated for two trans-membrane proteins, namely respiratory Complex I from Thermus thermophilus and the Na⁺/H⁺-antiporter from Methanocaldococcus jannaschii (MjNhaP1). These systems were studied by applying molecular dynamics simulations, quantum mechanics/classical mechanics simulation, and free energy calculations. The results lead to an improved understanding of the ion selectivity in MjNhaP1, and an estimation of free energy profiles of the quinone substrate into the active site of complex I, with implications for understanding the coupling mechanism in both systems.     «

In this dissertation, the molecular mechanism of active ion transport across a biological membrane was investigated for two trans-membrane proteins, namely respiratory Complex I from Thermus thermophilus and the Na⁺/H⁺-antiporter from Methanocaldococcus jannaschii (MjNhaP1). These systems were studied by applying molecular dynamics simulations, quantum mechanics/classical mechanics simulation, and free energy calculations. The results lead to an improved understanding of the ion selectivity in...     »

In dieser Dissertation wurde der molekulare Mechanismus von aktiven Ionentransporten durch die biologische Membran für zwei Transmembranproteine erforscht, Komplex I der Atmungskette von Thermus thermophilus und einen Na⁺/H⁺-Antiporter von Methanocaldococcus jannaschii (MjNhaP1). Diese Systeme wurden unter der Verwendung von Molekulardynamischen Simulationen, Quantenmechanischen/Molekularmechanischen Simulationen und Berechnungen der freien Energie untersucht. Die Ergebnisse führen zu einem besserten Verständnis der Ionenselektivität in MjNhaP1 und einer Abschätzung von freien Energieprofilen des Ubichinon Substrates in der aktiven Bindungsstelle von Komplex I. Davon ausgehend sind Rückschlüsse auf den Kopplungsmechanismus in beiden Systemen möglich.     «

In dieser Dissertation wurde der molekulare Mechanismus von aktiven Ionentransporten durch die biologische Membran für zwei Transmembranproteine erforscht, Komplex I der Atmungskette von Thermus thermophilus und einen Na⁺/H⁺-Antiporter von Methanocaldococcus jannaschii (MjNhaP1). Diese Systeme wurden unter der Verwendung von Molekulardynamischen Simulationen, Quantenmechanischen/Molekularmechanischen Simulationen und Berechnungen der freien Energie untersucht. Die Ergebnisse führen zu einem bess...     »