Chemical protein manipulations and their application in proteomics data mining
Übersetzter Titel:
Chemische Proteinmanipulationen und ihr Einsatz in der proteomischen Datenanalyse
Autor:
Stahl, Matthias
Jahr:
2018
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät für Chemie
Betreuer:
Sieber, Stephan A. (Prof. Dr.)
Gutachter:
Sieber, Stephan A. (Prof. Dr.); Feige, Matthias (Prof. Dr.); Verhelst, Steven (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
CHE Chemie
TU-Systematik:
CHE 600d; CHE 800d
Kurzfassung:
The survival of all types of cells is dependent on functional protein homeostasis. One of its controllers, ClpP, is a serine protease. Here, the cleavage specificities of different ClpPs, the activation of human ClpP and the functional roles of Staphylococcal ClpP in a systems biology context are elucidated. Mass spectrometry-based proteomics and novel bioinformatics methods for data mining allowed insights into ClpP’s mechanism of action, its cellular environment and beyond.
Übersetzte Kurzfassung:
Das Überleben aller Arten von Zellen ist abhängig von einer funktionierenden Proteinhomöostase. Eines der Regelproteine, ClpP, ist eine Serinprotease. In dieser Arbeit wird die Schnittstellenspezifität verschiedener ClpPs, die Aktivierung der humanen ClpP und die systembiologische Rolle von ClpP aus Staphylokokken beleuchtet. Massenspektrometrie-basierte Proteomik und neue Bioinformatikmethoden erlaubten Einblicke in den Wirkmechanismus von ClpP, seine zelluläre Umgebung und darüber hinaus.
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