Functional analysis of selective aldehyde dehydrogenase 1A1 inhibition by cytotoxic duocarmycin analogs and LC-MS-based metabolomic profiling of polar metabolites in bacteria
Translated title:
Funktionsanalyse der selektiven Aldehyddehydrogenase 1A1 Inhibition durch zytotoxische Duocarmycin Analoga und LC-MS basierte, metabolomische Analyse von polaren Metaboliten in Bakterien
Sieber, Stephan A. (Prof. Dr.); Eisenreich, Wolfgang (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; CHE Chemie
TUM classification:
CHE 600d; CHE 800d
Abstract:
The first part of this work is about the unsurpassed selectivity of Duocarmycin analogues for ALDH1A1. The molecular origin of this unique preference was revealed through cocrystallization, molecular dynamics calculations, mutational studies, and kinetic analysis. In the second part of this work liquid chromatography-mass spectrometry-based (LC-MS) methods for the analysis of polar metabolites in bacteria were implemented and applied.
Translated abstract:
Die vorliegende Arbeit befasst sich im ersten Teil mit der Aufklärung der einzigartigen Selektivität von Duocarmycin-Analoga für die ALDH1A1. Der molekulare Ursprung dieser Präferenz wurde durch Kokristallisation, Molekulardynamikrechnungen, Mutationsstudien und kinetische Analysen aufgeklärt. Im zweiten Teil der Arbeit wurden Methoden zur Flüssigkeitschromatographie-Massenspektrometrie (LC-MS)-basierten Analyse von polaren Metaboliten in Bakterien implementiert und angewendet.
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