This thesis deals with the modeling of gene expression (protein synthesis) using frame synchronization, a method applied in digital data transmission. There, the receiver detects the beginning of a message based on short signaling sequences, so-called synchronization words. Analogously, nature makes use of fixed sequence motifs to mark the beginning of fundamental DNA regions. This analogy allows to adapt techniques from frame synchronization and to apply these to available genomes using simulations. The two main steps of gene expression, transcription and translation, are modeled as a frame synchronization process. For a continuative analysis of the DNA sequences, classical information theoretic measures are applied. The results of this thesis indicate that the synchronization words of gene expression and their surrounding have been chosen nearly optimally in the communications engineering sense.     «

This thesis deals with the modeling of gene expression (protein synthesis) using frame synchronization, a method applied in digital data transmission. There, the receiver detects the beginning of a message based on short signaling sequences, so-called synchronization words. Analogously, nature makes use of fixed sequence motifs to mark the beginning of fundamental DNA regions. This analogy allows to adapt techniques from frame synchronization and to apply these to available genomes using simulat...     »

Diese Arbeit behandelt die Modellierung der Genexpression (Proteinsynthese) durch die Rahmensynchronisation, einem Verfahren der digitalen Datenübertragung. Hierbei detektiert der Empfänger den Beginn einer Nachricht anhand kurzer Signalisierungssequenzen, sogenannter Synchronisationswörter. Analog dazu verwendet die Natur feste Sequenzmotive, um den Beginn von fundamentalen DNA-Regionen zu markieren. Diese Analogie erlaubt es, Methoden der Rahmensynchronisation anzupassen und mittels Simulationen auf verfügbare Genome anzuwenden. Die beiden Hauptschritte der Genexpression, Transkription und Translation, werden als Rahmensynchronisationsprozess modelliert. Zur weiterführenden Untersuchung der DNA-Sequenzen werden klassische informationstheoretische Maße verwendet. Die Ergebnisse dieser Arbeit belegen, dass die Synchronisationswörter der Genexpression und ihre Umgebung im nachrichtentechnischen Sinne nahezu optimal gewählt wurden.     «

Diese Arbeit behandelt die Modellierung der Genexpression (Proteinsynthese) durch die Rahmensynchronisation, einem Verfahren der digitalen Datenübertragung. Hierbei detektiert der Empfänger den Beginn einer Nachricht anhand kurzer Signalisierungssequenzen, sogenannter Synchronisationswörter. Analog dazu verwendet die Natur feste Sequenzmotive, um den Beginn von fundamentalen DNA-Regionen zu markieren. Diese Analogie erlaubt es, Methoden der Rahmensynchronisation anzupassen und mittels Simulation...     »