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Original title:
Identification, characterization and validation of neoantigens and neoantigen-reactive T cells in their distinct tumor microenvironment of patients included in the ImmuNEO MASTER pan-cancer cohort
Translated title:
Identifizierung, Charakterisierung und Validierung von Neoantigenen und neoantigenreaktiven T-Zellen in ihrer spezifischen Tumormikroumgebung von Patienten der Pan-Krebs-Kohorte „ImmuNEO MASTER“
Author:
Tretter, Celina
Year:
2024
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Medicine and Health
Institution:
Professur für Translationale Immuntherapie (Prof. Krackhardt)
Advisor:
Krackhardt, Angela (Prof. Dr.)
Referee:
Krackhardt, Angela (Prof. Dr.); Gagneur, Julien (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
NAT Naturwissenschaften (allgemein)
TUM classification:
MED 450
Abstract:
In this pan-cancer study, 32 patients with 25 tumor types underwent comprehensive analysis, integrating proteogenomics for neoantigen discovery with phenotypic and functional analysis. Irrespective of entity, 90 neoantigens (32 validated) were identified, predominantly from RNA variants. 8 validated neoantigens showed in vitro immunogenicity. This study underscores the significance of RNA-derived variants in neoantigen identification and offers insights for enhancing future clinical applications...     »
Translated abstract:
Proteogenomische Analysen zur Neoantigenidentifizierung sowie phänotypische und funktionelle Analysen wurden bei Tumorproben von 32 Patienten mit 25 Entitäten durchgeführt. Unabhängig der Tumorentität wurden 90 Neoantigene (32 validiert) nachgewiesen, meist auf RNA-Varianten basierend. Immunogenität wurde für 8 dieser Neoantigene nachgewiesen. Dies unterstreicht die Bedeutung von RNA-basierten Varianten für die Neoantigenidentifizierung und gibt Vorschläge zur Verbesserung zukünftiger Pipelines.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1730284
Date of submission:
10.01.2024
Oral examination:
08.10.2024
File size:
10651768 bytes
Pages:
233
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20241008-1730284-1-2
Last change:
11.11.2024
 BibTeX