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Original title:
Leveraging transcription factor binding site patterns: from diabetes risk loci to disease mechanisms
Translated title:
Von Diabetes Risikoregionen zu Erkrankungsmechanismen unter Ausnutzung von Transkriptionsfaktor Bindungsstellen Mustern
Author:
Claussnitzer, Melina Christine
Year:
2014
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Hauner, Johann J. (Prof. Dr.)
Referee:
Hauner, Johann J. (Prof. Dr.); Illig, Thomas (Prof. Dr.); Mellgren, Gunnar (Prof. Dr. Dr.); Skurk, Thomas (Priv.-Doz. Dr.)
Language:
en
Subject group:
LEB Lebensmitteltechnologie; OEK Ökotrophologie, Ernährungswissenschaft
Keywords:
Regulatory genomics, disease genetics, type 2 diabetes, systems biology
Translated keywords:
Regulatorische Genomik, Erkrankungsgenetik, Typ II Diabetes, Systembiologie
TUM classification:
OEK 100d; LEB 050d
Abstract:
Genome-wide association studies revealed a plethora of risk loci associated with diverse diseases. However, identification of the disease-causing variants remains a major challenge in medical genetics. In this thesis, I developed a novel computational method, called PMCA. I show that integrative computational analysis of phylogenetic conservation with a complexity assessment of co-occurring transcription factor binding sites can identify cis-regulatory variants and elucidate their mechanistic ro...     »
Translated abstract:
Genomweite Assoziationsstudien haben eine Vielzahl von genomischen Regionen mit verschiedensten Erkrankungen assoziiert. Die Identifizierung von Varianten, die eine Erkrankung hervorrufen ist jedoch nach wie vor eine schwierige Herausforderung im Feld der medizinisch ausgerichteten Genetik. In dieser Arbeit habe ich eine bioinformatische Methode namens PMCA entwickelt. Ich zeige, dass die bioinformatische Analyse von phylogenetischer Konserviertheit mit einer Komplexitätserfassung von gemeinsam...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1190448
Date of submission:
07.02.2014
Oral examination:
27.05.2014
File size:
12971571 bytes
Pages:
236
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20140527-1190448-1-3
Last change:
29.07.2016
 BibTeX