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Original title:
Evolution of gene networks involved in adaptation to stressful environments in Solanum chilense
Translated title:
Evolution von Gennetzwerken, die an der Anpassung an stressige Umgebungen in Solanum chilense beteiligt sind
Author:
Wei, Kai
Year:
2022
Document type:
Dissertation
Institution:
TUM School of Life Sciences
Advisor:
Tellier, Aurélien (Prof. Dr.)
Referee:
Tellier, Aurélien (Prof. Dr.); Parsch, John (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
Keywords:
evolution, adaptation, gene network
Translated keywords:
Evolution, Anpassung, Gennetzwerk
TUM classification:
BIO 450
Abstract:
In this thesis, whole-genome and transcriptome sequencing data are used to analyze the genetic basis of polygenic adaptation in Solanum chilense. We correlate the demographic history, allele frequencies in space and time, the selection events and the ecological niche spanning 150,000 years. We then identified gene networks responding to drought stress and estimated the evolution of gene networks. Our results provide an insight into polygenic adaptation to stressful environments in S. chilense.
Translated abstract:
In dieser Arbeit werden Genom- und Transkriptomdaten verwendet, um die Grundlage der polygenen Anpassung bei Solanum chilense zu analysieren. Wir setzen die demografische Geschichte, die Allelhäufigkeiten in Raum und Zeit, die Selektionsereignisse und ökologische Nische über eine Zeit von 150.000 Jahren in Beziehung. Anschließend haben wir Trockenstress-Gennetzwerke identifiziert und die Entwicklung dieser untersucht. Unsere Ergebnisse zeigen die polygene Anpassung an stressreiche Umgebungen.
Date of submission:
02.11.2021
Oral examination:
02.02.2022
File size:
38952049 bytes
Pages:
128
Last change:
03.03.2022
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