Evolution of gene networks involved in adaptation to stressful environments in Solanum chilense
Übersetzter Titel:
Evolution von Gennetzwerken, die an der Anpassung an stressige Umgebungen in Solanum chilense beteiligt sind
Autor:
Wei, Kai
Jahr:
2022
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Life Sciences
Betreuer:
Tellier, Aurélien (Prof. Dr.)
Gutachter:
Tellier, Aurélien (Prof. Dr.); Parsch, John (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
Stichworte:
evolution, adaptation, gene network
Übersetzte Stichworte:
Evolution, Anpassung, Gennetzwerk
TU-Systematik:
BIO 450
Kurzfassung:
In this thesis, whole-genome and transcriptome sequencing data are used to analyze the genetic basis of polygenic adaptation in Solanum chilense. We correlate the demographic history, allele frequencies in space and time, the selection events and the ecological niche spanning 150,000 years. We then identified gene networks responding to drought stress and estimated the evolution of gene networks. Our results provide an insight into polygenic adaptation to stressful environments in S. chilense.
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Arbeit werden Genom- und Transkriptomdaten verwendet, um die Grundlage der polygenen Anpassung bei Solanum chilense zu analysieren. Wir setzen die demografische Geschichte, die Allelhäufigkeiten in Raum und Zeit, die Selektionsereignisse und ökologische Nische über eine Zeit von 150.000 Jahren in Beziehung. Anschließend haben wir Trockenstress-Gennetzwerke identifiziert und die Entwicklung dieser untersucht. Unsere Ergebnisse zeigen die polygene Anpassung an stressreiche Umgebungen.
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