Graph-Based Methods for the Integration of Lipidome and Metabolome Data into the Omics-Landscape

Köhler, Nikolai

TUM School of Life Sciences

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Original title:: Graph-Based Methods for the Integration of Lipidome and Metabolome Data into the Omics-Landscape
Translated title:: Graph-basierte Methoden zur Integration von Lipidom und Metabolom Daten in die omik-Landschaft
Author:: Köhler, Nikolai
Year:: 2024
Document type:: Dissertation
Faculty/School:: TUM School of Life Sciences
Institution:: Nachwuchsforschungsgruppe LipiTUM - A Computational Platform for Lipidomics and Lipotyping in Systems Medicine
Advisor:: Pauling, Josch Konstantin (Dr.)
Referee:: Pauling, Josch Konstantin (Dr.); Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.); Hauschild, Anne-Christin (Jun. Prof. Dr.)
Language:: en
Subject group:: BIO Biowissenschaften; MED Medizin
Keywords:: Bioinformatics,Metabolic Networks,Network Enrichment,Lipidomics,Metabolomics
Translated keywords:: Bioinformatik,Metabolische Netzwerke,Netzwerk Enrichment,Lipidomik,Metabolomik
TUM classification:: MED 230; BIO 784; OEK 412
Abstract:: Current metabolomics and lipidomics research is often limited by computational methods for interpreting experimental results and integrating them with data from other omics disciplines. This dissertation presents computational approaches that build on biochemical knowledge in the form of metabolic networks to close this gap. It demonstrates how these methods can extract hypotheses from metabolomics experiments and aid the integration of lipidomics and metabolomics with other omics disciplines.
Translated abstract:: Aktuell ist Metabolom- und Lipidom-Forschung häufig in der rechnergestützen Interpretation experimenteller Daten und deren Integration mit anderen Omik-Disziplinen eingeschränkt. Diese Dissertation präsentiert Ansätze, die auf biochemischem Wissen in Form von metabolischen Netzwerken aufbauen, um diese Lücke zu schließen. Es wird gezeigt, wie diese Hypothesen aus Metabolomik-Experimenten extrahieren und die Integration von Lipidomik und Metabolomik mit anderen Omik-Disziplinen unterstützen.
WWW:: https://mediatum.ub.tum.de/?id=1734671
Date of submission:: 09.02.2024
Oral examination:: 12.08.2024
File size:: 13324074 bytes
Pages:: 152
Urn (citeable URL):: https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20240812-1734671-1-8
Last change:: 20.09.2024
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