Anaerobic benzene degradation was studied with a sulfate- and an iron-reducing enrichment culture (BPL and BF). In culture BPL, molecular analysis revealed 95% dominance of a novel phylotype that is affiliated to the genus Pelotomaculum. To elucidate the initial activation mechanism of anaerobic benzene degradation, putative metabolites were screened revealing benzoate as a product of a carboxylation reaction. For identification of enzymes involved in anaerobic benzene degradation the whole proteomes expressed in benzene-, phenol-, and benzoate-grown cells of culture BF were separated by SDS gels. A specific benzene-expressed protein band with a mass of 60 kDa was identified by N-terminal sequencing. The amino acid sequence was similar to known carboxylases. A combined shotgun genome sequencing together with a proteomic analysis identified a cluster of ORFs containing the same putative anaerobic benzene carboxylase (Abc) enzyme. The respective putative genes were also identified from the proteome of culture BPL suggesting that carboxylation is a common activation mechanism in anaerobic benzene degradation.      «

Anaerobic benzene degradation was studied with a sulfate- and an iron-reducing enrichment culture (BPL and BF). In culture BPL, molecular analysis revealed 95% dominance of a novel phylotype that is affiliated to the genus Pelotomaculum. To elucidate the initial activation mechanism of anaerobic benzene degradation, putative metabolites were screened revealing benzoate as a product of a carboxylation reaction. For identification of enzymes involved in anaerobic benzene degradation the whole prot...     »

Anaerober Benzen-Abbau wurde mit Hilfe einer Sulfat- und einer Eisenreduzierenden Anreicherungskultur untersucht (BPL und BF). Phylogenetische Analysen zeigten, dass Kultur BPL zu 95% von einem bisher unbekannten Mikroorganismus des Genus Pelotomaculum dominiert wird. Metabolitenanalyse ergab Benzoat als Zwischenprodukt, was auf eine Carboxylierungsreaktion von Benzen schließen lässt. Dies wurde durch eine Proteomische Analyse von Kultur BF unterstützt. Wachstum auf den Substraten Benzen, Phenol und Benzoat zeigte eine deutliche Bande in SDS-Gelen, die nur bei Benzen expremiert wurde. Edman-Sequenzierung dieser Bande ergab Sequenzhomologie zu bekannten Carboxylasen. Eine umfassendere Shotgun-Sequenzierung verbunden mit einer Proteomischen Analyse zeigte eine Reihe von Proteinen, die nur bei Benzen expremiert wurden und in einem Gencluster um die erwähnte Anaerobe Benzen Carboxlase (Abc) codiert sind. Ähnliche Genprodukte wurden in der Sulfatreduzierenden Kultur bei Wachstum auf Benzol gefunden, was Carboxylierung als generellen Mechanismus des anaeroben Benzenabbaus nahe legt.      «

Anaerober Benzen-Abbau wurde mit Hilfe einer Sulfat- und einer Eisenreduzierenden Anreicherungskultur untersucht (BPL und BF). Phylogenetische Analysen zeigten, dass Kultur BPL zu 95% von einem bisher unbekannten Mikroorganismus des Genus Pelotomaculum dominiert wird. Metabolitenanalyse ergab Benzoat als Zwischenprodukt, was auf eine Carboxylierungsreaktion von Benzen schließen lässt. Dies wurde durch eine Proteomische Analyse von Kultur BF unterstützt. Wachstum auf den Substraten Benzen, Phenol...     »