Zur Untersuchung der Vorgänge während der frühen Trächtigkeit auf Ebene der Genexpression wurden Endometriumproben an Tag 12 und an Tag 14 gesammelt und mit Hilfe der Transkriptom-Sequenzierung (RNA-Seq) untersucht. Weiterhin wurden die RNA-Seq-Daten mit Mikroarray-Daten verglichen, mit verschiedenen bioinformatischen Tools (DESeq, GSEA, DAVID) ausgewertet und mittels quantitativer Real-time RT-PCR validiert. Die Auswertung ergab ein sehr komplexes Bild an Transkriptomveränderungen während der frühen Trächtigkeit.     «

Zur Untersuchung der Vorgänge während der frühen Trächtigkeit auf Ebene der Genexpression wurden Endometriumproben an Tag 12 und an Tag 14 gesammelt und mit Hilfe der Transkriptom-Sequenzierung (RNA-Seq) untersucht. Weiterhin wurden die RNA-Seq-Daten mit Mikroarray-Daten verglichen, mit verschiedenen bioinformatischen Tools (DESeq, GSEA, DAVID) ausgewertet und mittels quantitativer Real-time RT-PCR validiert. Die Auswertung ergab ein sehr komplexes Bild an Transkriptomveränderungen während der f...     »

Endometrial tissue samples were collected on days 12 and 14 of pregnancy and subjected to transcriptome analysis by the use of Illumina RNA-Seq to investigate the processes in the endometrium during early pregnancy at the level of gene expression. Furthermore, the obtained RNA-Seq data sets were compared with a published microarray data set. For further characterization, different bioinformatic tools (GSEA, DAVID) were used. The expression of selected genes was validated by the use of quantitative real-time RT-PCR. Overall, the data analysis revealed a comprehensive picture of transcriptome changes in porcine endometrium during early pregnancy.     «

Endometrial tissue samples were collected on days 12 and 14 of pregnancy and subjected to transcriptome analysis by the use of Illumina RNA-Seq to investigate the processes in the endometrium during early pregnancy at the level of gene expression. Furthermore, the obtained RNA-Seq data sets were compared with a published microarray data set. For further characterization, different bioinformatic tools (GSEA, DAVID) were used. The expression of selected genes was validated by the use of quantitati...     »