Die Gruppe der Chlamydien umfasst bakterielle Symbionten in niederen Eukaryoten, als auch humanpathogene Bakterien. Die Aufklärung ihrer molekularen Mechanismen ist schwierig, da wegen der intra-zellulären Lebensweise der isolierte Organismus nicht zugänglich ist. Die Vorhersage von Interaktionsnetzwerken mit Hilfe der Bioinformatik konnte zur Identifizierung funktionaler Module auf Basis der Genominformation genutzt werden. Diese wurden zur Funktionsvorhersage sowie zur Identifizierung unbekannter Virulenzfaktoren eingesetzt. Eine evolutionäre Analyse in Bezug auf unterschiedliche Anpassung an den Wirt zeigte, wie und welche zelluläre Funktionen in den pathogenen Spezies verloren gingen. Ein wichtiger Transportweg für sogenannte Effektorproteine ist das Typ III Sekretionssytem welches in vielen gram(-) Bakterien Effektoren in die Wirtszelle transportiert. Es konnte gezeigt werden, dass das Erkennungssignal für diesen Transport speziesunabhängig ist und modelliert werden kann. Die daraus resultierende Software (EffectiveT3) ermöglicht die Vorhersage von wahrscheinlichen Effektoren an Hand ihrer Sequenz, welche die Entdeckung neuer Effektoren beschleunigen wird.
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Die Gruppe der Chlamydien umfasst bakterielle Symbionten in niederen Eukaryoten, als auch humanpathogene Bakterien. Die Aufklärung ihrer molekularen Mechanismen ist schwierig, da wegen der intra-zellulären Lebensweise der isolierte Organismus nicht zugänglich ist. Die Vorhersage von Interaktionsnetzwerken mit Hilfe der Bioinformatik konnte zur Identifizierung funktionaler Module auf Basis der Genominformation genutzt werden. Diese wurden zur Funktionsvorhersage sowie zur Identifizierung unbekann...
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