Neue Entwicklungen in der biotechnologischen Apparatetechnik ermöglichen die umfassende Analyse von Organismen in den Bereichen der Genomik, Transkriptomik und Proteomik. Um die heterogenen Datentypen in ihrem genomischen Kontext graphisch darzustellen, wurden in dieser Arbeit generische Lösungen für die Abbildung von Transkript- und Proteinsequenzen auf genomische Referenzdatensätze entwickelt. Ergänzend wurde eine Applikation zur automatischen Funktionsannotation von EST-Datensätzen geschaffen, die statistische Analysen zur Über- bzw. Unterrepräsentation funktioneller Module durchführt. Um die Datenintegration für systembiologische Analysen zu unterstützen, wurde ein Werkzeug entwickelt, das die automatische Cross-Referenzierung von Einträgen aus verschiedenen Datenbanken erlaubt. Dazu wurden Listen mehrdeutiger biologischer Terme erstellt, die das Text Mining in den biomedizinischen Wissenschaften verbessern werden.     «

Neue Entwicklungen in der biotechnologischen Apparatetechnik ermöglichen die umfassende Analyse von Organismen in den Bereichen der Genomik, Transkriptomik und Proteomik. Um die heterogenen Datentypen in ihrem genomischen Kontext graphisch darzustellen, wurden in dieser Arbeit generische Lösungen für die Abbildung von Transkript- und Proteinsequenzen auf genomische Referenzdatensätze entwickelt. Ergänzend wurde eine Applikation zur automatischen Funktionsannotation von EST-Datensätzen geschaffen...     »

Recent developments in bioanalytical techniques allow for comprehensive analyses of organisms with respect to genomics, transcriptomics and proteomics. To visualize the heterogeneous data types in their genomic context, generic methods for mapping transcript and protein sequences to genomic reference data sets have been developed. Additionally, an application for automated functional annotation of sets of ESTs, that statistically analyses the enrichment and depletion of functional modules has been established. To provide data integration for systems biology approaches, a tool for automated cross-referencing of entries from different databases has been designed. For that purpose lists of ambiguous biological terms were created, that will allow for enhanced text mining in biomedical science.     «

Recent developments in bioanalytical techniques allow for comprehensive analyses of organisms with respect to genomics, transcriptomics and proteomics. To visualize the heterogeneous data types in their genomic context, generic methods for mapping transcript and protein sequences to genomic reference data sets have been developed. Additionally, an application for automated functional annotation of sets of ESTs, that statistically analyses the enrichment and depletion of functional modules has be...     »