Novel analytical and data analytical approaches for Caenorhabditis elegans metabolomics and lipidomics
Übersetzter Titel:
Neue analytische und datenanalytische Ansätze für die Metabolomik und Lipidomik von Caenorhabditis elegans
Abstract:
The nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) is one of the most important model organisms in biomedical research. Metabolomics and lipidomics have only recently been added to the methods used to study the biology of the worm. Despite years of research on C. elegans metabolism, only a small fraction of the metabolome and lipidome is known, and even fewer metabolites can be annotated in typical metabolomics/lipidomics experiments. To fill this gap, new approaches for the analysis and interpretation of metabolomic and lipidomic data have been generated, including genome-scale metabolic models and new workflows for the annotation and identification of metabolites and lipids. In addition, new analytical methods such as ion mobility for the analysis of lipids, tandemLC-MS for the analysis of polar and non-polar metabolites in a single run, and a method for the analysis of fatty acids from individual C. elegans were developed. All these new approaches will help to analyze and evaluate the nematode metabolome and lipidome more fully in the future.
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The nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) is one of the most important model organisms in biomedical research. Metabolomics and lipidomics have only recently been added to the methods used to study the biology of the worm. Despite years of research on C. elegans metabolism, only a small fraction of the metabolome and lipidome is known, and even fewer metabolites can be annotated in typical metabolomics/lipidomics experiments. To fill this gap, new approaches for the analysis and interpret...
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übersetzter Abstract:
Der Fadenwurm Caenorhabditis elegans (C. elegans) ist einer der wichtigsten Modellorganismen in der biomedizinischen Forschung. Die Metabolomik und Lipidomik wurden erst kürzlich zu den Methoden zur Erforschung der Biologie des Wurms hinzugefügt. Trotz jahrelanger Forschung auf dem Gebiet des Stoffwechsels von C. elegans ist nur ein kleiner Teil des Metaboloms und Lipidoms bekannt, und noch weniger Metabolite können in typischen Metabolomik/Lipidomik-Experimenten annotiert werden. Um diese Lücke zu füllen, wurden neue Ansätze für die Analyse und Auswertung von metabolomischen und lipidomischen Daten generiert, inklusive genom-skalischer metabolischer Modelle und neuer Workflows für die Annotation und Identifizierung von Metaboliten und Lipiden. Zusätzlich wurden neue analytische Methoden wie Ionenmobilität für die Analyse von Lipiden, tandemLC-MS zur Analyse von polaren und nicht-polaren Metaboliten in einem einzelnen Lauf und einer Methode zur Analyse von Fettsäuren aus einzelnen C. elegans entwickelt. Alle diese neuen Ansätze werden in Zukunft helfen das Metabolom und Lipidom des Fadenwurms vollumfänglicher zu analysieren und auszuwerten.
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Der Fadenwurm Caenorhabditis elegans (C. elegans) ist einer der wichtigsten Modellorganismen in der biomedizinischen Forschung. Die Metabolomik und Lipidomik wurden erst kürzlich zu den Methoden zur Erforschung der Biologie des Wurms hinzugefügt. Trotz jahrelanger Forschung auf dem Gebiet des Stoffwechsels von C. elegans ist nur ein kleiner Teil des Metaboloms und Lipidoms bekannt, und noch weniger Metabolite können in typischen Metabolomik/Lipidomik-Experimenten annotiert werden. Um diese Lücke...
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